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【题04】计算最长重复子串--试题解析
串运算的应用——子串模式匹配
设s 为主串,t为模式串,q为s中第一个与t相等的子串。所谓模式匹配指的是
⑴若q存在,q的首字符在s中的位置;
⑵若q不存在,kmp算法就是其中最出色的一个算法。我们从一个实例引出讨论
【题4】计算最长重复子串
在一个字串中,多次出现的子串称为重复子串。如果这样的子串有多个,则其中长度最长的子串称为最长重复子串。例如s abcdacdac,t cdac为s的最长重复子串。请你在尽可能短的时间内找出最长重复子串。
输入:字符串s,长度不超过255
输出:s的最长重复子串
分析:
1、kmp算法
朴素的串匹配算法的时效之所以不尽人意,是因为有重复的计算。看下面的例子:
模式t ‘ATATACG’的第6个字符在当前位置无法匹配,朴素的串匹配算法将k递增1,从t的第一个字符开始重新匹配,但实际上此时可将k递增2,从t的第4个字符开始匹配,因为在这之间的匹配肯定会失败。类似的例子随着数据量的增大而越来越多,朴素的串匹配算法将做更多的重复工作,使得时效很低。为什么可以让k递增2,从t的第4个字符开始匹配呢?这是由t的性质决定的。
如上图所示,t的前缀‘ATA’恰好是t的前缀‘ATATA’的后缀,所以如果直到‘ATATA’都匹配成功,而‘ATATAC’匹配失败,则主串s的子串sk+2‥sk+4必定为‘ATA’(因为‘ATATA’在k处匹配成功,sk‥k+4 ‘ATATA’),于是t的前缀‘ATA’肯定在k+2处匹配成功。KMP算法正是利用了这种特性使得算法的时间复杂度降为O n+m 。
算法的关键是求t的前缀函数next,使得next[j] max k | k j t1‥tk-1 tj-k+1‥tj-1 。
next[j]
例如模式串‘ATATACG’
J 1 2 3 4 5 6 7 模式 A T A T A C G next[j] 0 1 1 2 3 4 1 观察上表
t[1] t[1],得出next[2] next[1]+1 1;
t[1]≠t[2],得出next[3] 1;
t[3] t[4] ’A’,得出next[4] next[3]+1 2;
t[1..2] t[3..4] ’AT’,得出next[5] next[4]+1 3;
t[1..3] t[3..5] ‘ATA’,得出next[6] next[5]+1 4;
t[6]前的任何一个前缀都不含字符‘C’,得出next[7] 1。
显然,在s与t顺序匹配的过程中,如果t[j]与主串s的当前字符不匹配,则s的当前字符与t[next[j]]比较,不需要从t[1]开始重新比较。移动的位置与s无关,取决于模式串t本身,求next j 实际上就相当于用t匹配t的过程。由于这个匹配过程是按照字符顺序依次进行的,因此是一个递推过程。设
Type
nexttype array[1..255]of integer;
Var
next:nexttype; t的前缀函数
我们通过get_next过程计算模式串t中每个字符的next值
procedure get_next t :string;var next:nexttype ; var j,k : integer; begin j←1; k0; next[1]0; 初始化 while j length t do 循环,next值 if k 0 or t[j] t[k] then begin 若不存在可匹配的子串或比较相等,next[j+1]←next[j]+1 j←j+1; kk+1; next[j]k; end then else k←next[k]; 否则依次类推找更短的子串
end; get_next
t的串长为m,则get_next过程的时间复杂度为W(m)。
2、使用kmp算法寻找子串
我们定义index s,t t 在主串s中位置的函数。让模式串t自左至右在主串s上滑动进行匹配检查。设q为s中第一个与t相等的子串,q存在,index s,t q的首字符在s中的位置, t不能是空串 。 例如:a bei;b beiging;c i;
index b,a 1; index b,c 3; index c,a 0;
index s,t next计算模式串t在主串s中的位置:模式匹配分别从s串和t串的首字符开始,s的第i个字符与模式串t的第j个字符匹配((j 0)or(s[i] t[j])),i指针和j指针(i←i+1;jj+1);
⑵如果主串s的第i个字符与模式串t的第j个字符匹配失败时((j 0)and(s[i] t[j])),si个字符应与t中第k(k next[j])个字符再比较。
上述过程一直进行到t串分析完或者s串分析完为止:
⑴如
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