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实用pcr流程表
临床PCR检验流程记录表
2008.10
检验日期: 检验项目: 扩增仪中保存文件名 使用说明:①严格按单一流向进行实验,即试剂准备区→标本制备区→扩增区,严禁逆向移动。本记录表的流向亦遵循此流程;②各项工作执行后在相应项目前的方框内打“√”;③本记录表最后归档保存在PCR实验室扩增区的专用文件夹中,以备查找。④Lightcycle 扩增仪中结果保存于D盘对应实验日期的文件夹中,如2008年9月的结果保存于“D:\2008\09\”中,每月底将当月资料备份于软盘中,保存2年。
实验前准备
□试剂在有效期内 □扩增仪、加样器、金属浴、温湿度计等仪器在校准有效期内(校准之日起1年)
□生物安全柜的滤膜在使用有效期内 □离心管、带滤芯吸头已经过质检合格
□各区按SOP配制含氯消毒液含氯消毒液操作者口生物工程有限公司 口 不正常按SOP清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上。 □ 按处理SOP处理实验废弃物。操作者 检验日期: 检验项目: 样本处理区
实验前:□更换专用工作服、戴口罩、帽子、鞋套 □实验台面清洁(500mg/L含氯消毒液、70%酒精或水擦拭) 冰箱温度:冷藏室(2~8℃) ℃; 冷冻室(-20±2℃) ℃
实验室温度 ℃(允许范围:15~30℃);相对湿度: (允许范围:30%~70%)
HBV-DNA阳性室内质控物来源: 浓度及批号: 扩增位置:
HBV-DNA阴性室内质控物来源: 批号: 扩增位置:
HCV-RNA阳性室内质控物来源: 浓度及批号: 扩增位置:
HCV-RNA阴性室内质控物来源: 批号: 扩增位置:
所处理的HBV-DNA标本(对应标本接收的唯一编号)及拟扩增位置:
1 9 17 25
2 10 18 26
3 11 19 27
4 12 20 28
5 13 21 29
6 14 22 30
7 15 23 31
8 16 24 32
所处理的HCV-RNA标本(对应标本接收的唯一编号)及拟扩增位置:
1 9 17 25
2 10 18 26
3 11 19 27
4 12 20 28
5 13 21 29
6 14 22 30
7 15 23 31
8 16 24 32
核酸提取及加样过程:□按乙型肝炎病毒DNA荧光定量PCR操作程序SOP进行。 □按丙型肝炎病毒RNA荧光定量PCR操作程序SOP进行。
仪器设备使用: 生物安全柜: □正常 □不正常; 恒温金属浴: ℃;
离心机: □正常 □不正常; 振荡器: □正常 □不正常; 低温离心机:制冷:□正常 □不正常; 离心:□正常 □不正常
实验后: □ 按SOP清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上。 □ 按处理SOP处理实验废弃物。口冷冻操作者按SOP清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上。 □ 按处理SOP处理实验废弃物。操作者n*2ul 计算好各试剂的使用量,加入到一适当体积试管中,充分混匀均匀后2000*g离心10秒,向各玻璃毛细管中分装15ul,转移至样本处理区。
加样(样本处理区)
吸取10ul样本处理步骤1.2.13中收集得到的RNA溶液及HCV定量标准品分别加入到上述反应管中(空白对照直接加入10ul洗脱液),盖紧反应管管盖,连同Roche专用金属反应管套放在离心机中,于2000*g离心10秒,将毛细管转移到检测区。将毛细管排放好放入荧光PCR检测仪内,记录样本摆放顺序。
4. RT-PCR反应(检测区)
4.1 循环条件设置
Program Cycles Temperature摄氏度 Incubation Time min:sec Temperature
Transition
Rate 摄氏度/sec Acquisition
Mode Analysis
Mode 1 1 50 30:00 20 None None 2 1 95 15:00 20 None None
3
45 95 00:05 20 None Quantification 50 00:30 20 Single 72 00:20 10 None 反应体系为25ul.具体设置方法请参照各仪器使用说明书。
仪器检测通道选择
选择F1检测通道:HCV内对照(IC)选择F2检测通道。
样本的设定
在扩增开始前条件设定时,将HCV定量标准品设为“Standard”并输入试剂盒内给定浓度值,待检样本和对照品设定为“Unknown”。
结果分析条件设定
对HCV的曲线和HCV内对照(IC)的曲线进行分别分析。
分析方式选择Fit Points,基线调整选
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