2015年深圳杯B题DNA序列论文.doc

2015年深圳杯B题DNA序列论文

封一 答卷编号(参赛学校填写): 答卷编号(竞赛组委会填写): 论文题目: 组 别: 参赛队员信息(必填): 姓 名 年级专业 学 号 联系电话 参赛队员1 邓鑫 参赛队员2 14机制二班 参赛队员3 14机制二班 指导教师:_____ 参赛学校: 封二 答卷编号(参赛学校填写): 答卷编号(竞赛组委会填写): 评阅情况(学校评阅专家填写): 学校评阅1. 学校评阅2. 学校评阅3___ _ 评阅情况(联赛评阅专家填写): 联赛评阅1. 联赛评阅2. 联赛评阅31问题重述   给定一个DNA 序列,这个系列只含有4 个字母ATCG,如S =“CTGTACTGTAT”。 给定一个整数值k,从S 的第一个位置开始,取一连续k 个字母的短串,称之为k-mer(如k= 5,则此短串为CTGTA), 然后从S 的第二个位置, 取另一k-mer(如k= 5,则此短串为TGTAC),这样直至S 的末端,就得一个集合,包含全部k-mer 。如对序列S 来说,所有5-mer 为 {CTGTA,TGTAC,GTACT

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