近交系數的计算.docVIP

近交系数的计算-答案 设有下列系谱，试用一般计算公式、共亲系数列表算法以及加性遗传相关算法分别求各个体的近交系数和个体间的亲缘系数。 E C A E C A H X F H X F G D B G D B 答： 一、近交系数的计算 （一）利用近交系数的一般公式计算 1. X个体 （1）父母A和B的共同祖先有：C、D、F、H；它们均为非近交个体(判断一个个体是否为近交个体的依据是看其父母是否有共同祖先，如果双亲只知道一方或均未知则默认其为非近交个体)，因此，FC =0，FD =0，FF =0，FH =0。 （2）找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出FX 通径链 共同祖先的近交系数 n1+n2+1 通径链的系数 A←C→B A←D→B A←C←F→D→B A←D←F→C→B A←C←E←H→G→D→B A←D←G←H→E→C→B ?FC =0 FD =0 FF =0 FF =0 FH =0 FH =0 3 3 5 5 7 7 ? ? ? FX = 21/64 2. A个体 （1）父母C和D的共同祖先有F和H，且FF =0，FH =0。 （2）找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出FA。 通径链 共同祖先的近交系数 n1+n2+1 通径链的系数 C←F→D A←E←F→G→D FF =0 FH =0 3 5 ? ? ? FA = 5/32 3.B个体，与A个体同父同母，因此与A相同。FB = 5/32。 4.其余个体C、D、E、F、G、H均为非近交个体，FC =0，FD =0，FE =0，FF =0，FG =0，FH =0。 （二）利用加性遗传相关列表算法 1. 将系谱中的个体按照世代从高到低分别从左到右、从上到下排列，并将个体的双亲编号列于个体的上方。 2. 利用公式 计算两两个体间的加性遗传相关，并列表。其中，x、y分别表示任意一个个体；xs、xd分别表示x个体的父亲和母亲；ys、yd分别表示y个体的父亲和母亲。 个体间加性遗传相关 H H EF EF CD CD AB H E G F C D A B X H 1 1/2 1/2 0 1/4 1/4 1/4 1/4 1/4 E 1 1/4 0 1/2 1/8 5/16 5/16 5/16 G 1 0 1/8 1/2 5/16 5/16 5/16 F 1 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 C 1 5/16 21/32 21/32 21/32 D 1 21/32 21/32 21/32 A 37/32 21/32 29/32 B 37/32 29/32 X 85/64 3.利用公式 计算每个个体的近交系数：FH = 1 - 1 = 0, FE = 1 - 1 = 0，FG = 1 - 1 = 0=0，FF = 1 - 1 = 0，FC = 1 - 1 = 0，FD = 1 - 1 = 0，FA = 37/32- 1 = 5/32，FB = 37/32- 1 = 5/32，FX = 85/64- 1 = 21/64。 二、亲缘系数的计算 根据个体间加性遗传相关列表中的数据，利用公式 计算两两个体间的亲缘系数。 个体间亲缘系数 H E G F C D A B X H 1/2 1/2 0 1/4 1/4 2/ E 1/4 0 1/2 1/8 2.5/ 2.5 2.5/ G 0 1/8 1/2 2.5/ 2.5 2.5/ F 1/2 1/2 2/ 2/ 4/ C 5/16 5.25/ 5.25/ 5.25/ D 5.25/ 5.25/ 5.25/ A 21/37 58/ B 58/