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转基因植物产品检测实室一览
转基因植物产品检测实验室一览
序号 仪器名称 用途 参考品牌型号与配置 大大致预算 1 高速冷冻离心机 生物样品的高速分离(冷冻保持样品生活活性)。 德国eppendorf;美国Thermo;德国Sigma;德国Herolab。 50000 120000 2 定性PCR扩增仪 50000 110000 定量CR扩增仪 美国ABI、德国eppendorf、美国Bio-rad。 250000 780000 3 PCR专用工作台 保证PCR时的无污染。(或建设标准的PCR层流实验室) 德国Peqlab。
(国产超净台也可替代。) 10000 34000 4 电泳槽、电泳仪 基因片段扩增之后跑凝胶。 德国Peqlab、美国Bio-rad。或北京六一。 15000 40000 5 凝胶成像系统 对凝胶进行分子量、等定性分析 法国VL,美国Bio-rad、或国产。 350000 150000 6 紫外透射仪 国产 6000 15000 7 制冰机 国产 20000 35000 8 CO2培养箱 美国Tehrmo。美国shellab 20000 50000 9 液氮罐 国产。 4000 10000 10 超纯水 美国millipore;美国Tehrmo。 40000 76000 双蒸馏水发生器 国产 4000 18000 11 分子生物常用耗材与试剂 5000 10000 12 转基因专用试剂 5000 10000 其他设备:
细胞融合仪核酸提取仪-30℃低温冰箱漩涡混合器超声波细胞粉碎仪自动恒温酶标7 操作步骤
7.1 抽样
参照 NY/T672 转基因植物及其产品检测 通用要求和NY/T673 转基因植物及其产品检测 抽样。
7.2 制样
7.3 DNA模板的制备00-400 mg试样,在液氮中磨碎,装入已经用液氮预冷的1.5 ml离心管中。
加入1ml预冷至4 ℃的抽提液,剧烈摇动混匀后,在冰上静置5分钟,用13 000 r/min离心机,4 ℃离心15 min,弃去上清液。
加入600 μl 预热到65 ℃的抽提裂解液,用玻棒搅拌上下颠倒充分混匀,在65 ℃的水浴锅中裂解40 min。
用13 000 r/min离心机室温离心10 min,将上清液转至另一离心管中,加入5 μl RNase A (10 mg/ml),37 ℃ 水浴30 min。
分别用等体积苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提一次。
用13 000 r/min离心机室温离心10 min,将上清转至另一离心管中。加入2/3体积异丙醇,1/10 体积3M乙酸钠(pH 5.6),-20 ℃ 放置2-3 h,充分沉淀DNA。
13 000 r/min,4 ℃ 离心15 min,用70%乙醇洗沉淀一次,倒出乙醇,晾干DNA。加入50 μl TE(pH8.0)溶解DNA。
把DNA溶液浓度用重蒸馏水调制为100ng/μl,储存于-20 ℃备用。
注意:
I 1 g试样(如棉花种子)提取的DNA量应不小于200 μg。
II DNA的OD260/OD280的比值应在1.8左右,且OD260的值应在曲线的最高峰。
7.4 PCR反应
7..1 试样的PCR反应
PCR反应管中按表1依次加入反应试剂, 用手指轻弹混匀,再加约50 μL石蜡油(有热盖设备的PCR仪可以不加石蜡油)。每个试样3次重复。
离心10s后,将PCR管插入PCR仪中。95℃变性5 min;进行35次循环扩增反应(Sad1基因、nos终止子、CaMV35S启动子:94℃,30 s56℃,30 s;72℃,30s;cry1Accry1Ab基因、以及cry1Ac与cry1Ab融合基因:94℃,1 min56℃, 1 min;72℃, 1 min );然后72℃恒温7 min,取出PCR反应管,对反应产物进行电泳检测或在4℃下保存。1 PCR反应体系
终浓度 单样品体积 ddH2O 31.25 10×PCR 缓冲液 1× 5 μl 25 mM MgCl2 2.5 mM 5 μl 10 mM dNTPs 0.2 mM 1 μl 10 μM Primer 1 0.5 μM 2.5 μl 10 μM Primer 2 0.5 μM 2.5 μl 5 U/μl Taq 酶 0.025 U/μl 0.25 μl 100 ng/μl DNA 模板 5 ng/μl 2.5 μl 总体积 50 μl
7.4.2 对照的PCR反应
PCR反应的同时,应设置阴性对照、阳性对照和空白对照。
DNA作为PCR反应体系的模板;阳性对照是指用转基因棉花材料中提取的DNA作为PCR反应体系的模板;空白对照是指
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