第七章 基因定位和图位克隆 一、主要分子标记分类 2.理想的分子标记的界定 理想的分子标记必须达到以下几个要求: (1)具有高的多态性; (2)共显性遗传,即利用分子标记可鉴别二倍体中杂合和纯合基因型; (3)能明确辨别等位基因; (4)除特殊位点的标记外,要求分子标记均匀分布于整个基因组; (5)选择中性(即无基因多效性); (6)检测手段简单、快速(如实验程序易自动化); (7)开发成本和使用成本尽量低廉; (8)在实验室内和实验室间重复性好(便于数据交换)。 2.1 限制片段长度多态性(RFLP ,Restriction?Fragment?Length?Polymorphism) RFLP已被广泛用于基因组遗传图谱构建、基因定位以及生物进化和分类的研究。RFLP是根据不同品种(个体)基因组的限制性内切酶的酶切位点碱基发生突变,或酶切位点之间发生了碱基的插入、缺失,导致酶切片段大小发生了变化,这种变化可以通过特定探针杂交进行检测,从而可比较不同品种(个体)的DNA水平的差异(即多态性),多个探针的比较可以确立生物的进化和分类关系。所用的探针为来源于同种或不同种基因组DNA的克隆,位于染色体的不同位点,从而可以作为一种分子标记(Mark),构建分子图谱。 当某个性状(基因)与某个(些)分子标记协同分离时,表明这个性状(基因)与分子标记连锁。分子标记与性状之间交换值的大
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