一种快速有效的细菌鉴定方法 传统的细菌鉴定方法是根据微生物的细胞形态、生理生化特征、血清学反应、噬菌体敏感性等多方面进行综合鉴定的,使用该方法进行鉴定的依据为细胞的表形特征,其缺点是检测项目多、工作量大、耗时、结果不稳定等,易出现弱反应或假阳性。 现代的方法:利用了PCR的方法,根据16s rDNA两端的保守序列,设计引物PCR扩增未知细菌的16s rRNA基因,然后对PCR扩增的DNA片段进行序列分析,经与GenBank中的已知序列进行同源性比较后,对未知菌种进行鉴定。该方法是在分子水平上对细菌进行的分类,具有快速、准确、重复性好等优点。 鉴定的原理 细菌的rRNA是细胞内含量最多的RNA,约占总量的80%以上,其分子量大,种类多,由高度保守区和可变区组成。细菌的rRNA包括5S、16S、23S,其中5S rRNA信息量少,不适合分析;23S rRNA分子大,信息量多,但碱基突变速度较快,同样不适于细菌鉴定;相比之下16S rRNA的遗传较为稳定,长度在1550±200bp左右,代表信息量适中,是研究系统进化的好材料。目前已报道了10000种以上的细菌16S rDNA序列,通过对16S rDNA序列分析,可以将细菌划分到属或种,对于难以培养的细菌、生化反应不明显及传统表型方法不能鉴定的细菌,使用该法鉴定细菌尤为方便。 本文以某食品公司的食品原料和加工后成品中的细菌检测为例,简述细
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