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第九章基因工程
基本概念
DNA重组
不同来源的DNA分子可以通过末端共价连接(磷酸二酯键)而形成重新组合的DNA分子,这一过程称为DNA重组。
1973年 重组DNA技术建立
克隆
作名词使用时,是指由一个细胞经过无性繁殖以后所形成的子代群体。
作动词使用时,是指产生这一群体的过程。
基因克隆
是指在体外,借助于能自我复制的载体,将目的基因引入到宿主细胞中进行增殖,以获得大量的特定DNA片段。也称为重组DNA,分子克隆。
基因工程
指在体外将基因进行克隆,并利用克隆的基因表达、制备特定的蛋白质或多肽产物,或定向改造细胞乃至生物体的特性所用的方法及相关的工作。
基因工程的目的
分离获得某一感兴趣的基因或DNA
获得感兴趣基因的表达产物(蛋白质)
第一节工 具 酶
一、限制酶
定义
是一类内切核酸酶,又称限制性核酸内切酶。能够识别双链DNA内部特异序列, 并在识别位点或其周围切割双链DNA。
+
Bam HⅠ
作用
与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统,限制外源DNA, 保护自身DNA。
分类
Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ
(基因工程技术中常用Ⅱ型)
分类
Ⅰ型
Ⅱ型
Ⅲ型
限制-修饰活性
限制和修饰活性
限制酶与修饰酶分开
限制和修饰活性
蛋白质结构
三种不同亚基
相同亚基
二种不同亚基
辅助因子
Mg 2+、ATP、SAM
Mg 2+
Mg 2+、ATP、 SAM*
切割位点
非特定,在识别位点下游100-1000bp
特定,在识别位点内,切割位点的序列可知、固定
切割位点难预测,在识别位点附近
1. 限制酶的分类
第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;
第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;
第四个字母代表株;
用罗马数字表示发现的先后次序。
2. 限制酶的命名
Hin dⅢ
Haemophilus influenzae Rd株
流感嗜血杆菌d株的第三种酶
Ⅱ类酶识别序列特点—— 回文结构(palindrome)
切口 :平端切口、粘端切口
3. 限制酶的识别和切割位点
4. 同功异源酶
+
Bam HⅠ
+
BstⅠ
来源不同的限制酶,但能识别和切割同一位点,这些酶称同功异源酶。
有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割DNA后,产生相同的粘性末端,称为同尾酶。这两个相同的粘性末端称为配伍未端。
Bam HⅠ
Bg lⅡ
+
+
5. 同尾酶
限制酶 识别序列及切口 限制酶 识别序列及切口
Alu Ⅰ AG/CT Hind Ⅲ A/AGCTT TC/GA TTCGA/A BamHⅠ G/GATCC SalⅠ G/TCGAC CCGAG/G CAGCT/G BglⅠ A/GATCT SmaⅠ CCC/GGG TCTAG/A GGG/CCC EcoRⅠ G/AATTC CTTAA/G
常用限制性核酸内切酶酶切序列
单酶切
? 用一种限制酶
酶切目的基因
和载体
? 易发生自身连
接
双酶切
? 用二种限制酶
酶切目的基因
和载体
? 不易发生自身
连接
限制性核酸内切酶酶切方法
二、修饰酶
DNA聚合酶Ⅰ
逆转录酶
T4DNA连接酶
碱性磷酸酶
末端脱氧核苷酸转移酶
DNA聚合酶Ⅰ
是从E.coli中第一个发现的DNA聚合酶
催化活性
5’→3’聚合酶活性;
5’→3’和 3’ →5’外切酶活性
应用
在用切口平移法标记DNA探针时,常用此酶。
Klenow 片段
定义:
用枯草杆菌蛋白酶可将DNA聚合酶Ⅰ裂解为大小两个片段,大片段称为Klenow片段。
催化活性:
5’→3’聚合酶活性; 3’ →5’外切酶活性
应用:
补齐双链DNA的3’末端;
通过补齐3’末端而对其进行标记;
在cDNA克隆中,催化第二条链的合成;
DNA序列的分析。
逆转录酶
常用两种类型
禽类成骨细胞性白血病病毒(AMV)逆转
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