第4章+蛋白质的共价结构研究.ppt

一、蛋白质通论 ２、蛋白质的含氮量 蛋白氮占生物组织所有含氮物质的绝大部分。 大多数蛋白质含氮量接近于16% 蛋白质含量 = 每克样品中含氮的克数?6.25 凯氏定氮法 ３、蛋白质的分类 （1）、依据外形分类 球状蛋白质：globular protein 外形接近球形或椭圆形，溶解性较好 纤维状蛋白质：fibrous protein 形似纤维或细棒，分可溶性/不溶性两种 膜蛋白质：membrane protein 亲水性残基少于胞质蛋白 （2）、依据蛋白质的组成分类 单纯蛋白 simple protein 单纯蛋白，仅由氨基酸组成 缀合蛋白 conjugated protein 单纯蛋白 清蛋白和球蛋白 albumin and globulin 广泛存在于动物组织 谷蛋白和醇溶谷蛋白 glutelin and prolamin 植物蛋白，不溶于水，易溶于稀酸/碱 鱼精蛋白和组蛋白 碱性蛋白存在于细胞核 硬蛋白 存在于软骨、腱、毛发、丝等组织中， 分为角/胶原/弹性/和丝蛋白等 缀合蛋白 糖蛋白：简单蛋白+糖类物质 脂蛋白：简单蛋白+脂类结合 核蛋白：简单蛋白+核酸 磷蛋白：含与Ser,Thr和Tyr残基的羟基酯化的磷酸基。 金属蛋白：含有金属离子的蛋白质 血红素蛋白：金属蛋白的一个亚类；辅基为血红素，是卟啉化合物。 黄素蛋白：含黄素，辅基为FMN和FAD。 （二）、蛋白质的大小与分子量 蛋白质是分子量很大的生物分子 对任一种给定的蛋白质，其所有分子在AA组成和顺序以及肽链的长度方面都应是相同的，即所谓均一的蛋白质。 （四）、蛋白质功能的多样性 1. 催化功能-酶 2. 调节功能-激素、基因调控因子 3. 转运功能-膜转运蛋白、血红/血清蛋白 4. 贮存功能-乳、蛋、谷蛋白 5. 运动功能-鞭毛、肌肉蛋白 6. 结构成分-皮、毛、骨、牙、细胞骨架 7. 支架作用-接头蛋白 8. 防御功能-免疫球蛋白 9. 异常功能 生老病死，万物轮回(蛋白质层次) 生（诞生、生长）：在酶催化下老细胞 计划性凋亡和新细胞的再生（新陈代谢）、活细胞的代谢 老？蛋白质功能普遍衰退(?) 病—个别蛋白质的功能障碍 死？蛋白质功能的全部停止/分解 蛋白质——生物功能分子 单细胞生物 多细胞动物 多肽链中AA残基按一定顺序排列：氨基酸顺序 含游离?-氨基的一端：氨基端或N-端 含游离?-羧基的一端：羧基端或C-端 AA顺序是从N-端开始以C-端氨基酸残基为终点 如上述五肽：Ser-Val-Tyr-Asp-Gln 反过来写的是一个不同的肽 （一）、肽和肽键的结构 肽键的特点是： ——N上孤对电子与羰基有明显的共轭作用。 ①肽键中C-N键有部分 双键性质 ——不能自由旋转 ②组成肽键原子处于 同一平面（肽平面） ③键长及键角一定 ④大多数情况以反式 结构存在 （三）、 天然存在的活性肽 生物体中多肽最重要的存在形式是作为蛋白质的亚单位； 有许多分子量比较小的寡（多）肽以游离状态存在，这类肽通常都具有特殊的生理功能，常称为活性肽。 如：脑啡肽、激素类多肽、抗生素类多肽、 谷胱甘肽、蛇毒多肽等 ? L-Leu-D-Phe-L-Pro-L-Val ? ? L-Orn L-Orn ? ? L-Val-L-Pro-D-Phe-L-Leu ? 短杆菌肽S(环十肽) ? 由细菌分泌，含有D-AA和一些不常见AA，如鸟氨酸（Ornithine, Orn）。 蛋白质测序前提 1.样品必需纯（97%以上） 2.知道蛋白质的分子量 3.知道蛋白质由几个亚基组成 4.测定蛋白质的AA组成并根据分子量 计算每种AA的个数 5.测定水解液中的氨量计算酰胺的含量 （一）、蛋白质测序策略 (1) 测定蛋白质分子中多肽链的数目 通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系，即可确定多肽链的数目。 （一）、蛋白质测序策略 (2) 多肽链的拆分 （一）、蛋白质测序策略 几条多肽链借助非共价键连接在一起，称为寡聚蛋白质，血红蛋白为四聚体，烯醇化酶为二聚体。 可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理，即可分开多肽链(亚基)。 （一）、蛋白质测序策略 (3