(OD值结果分析.docVIP

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(OD值结果分析

---------------------------------------------------------- 吸光度,absorbance,是指光线通过溶液或某一物质前的入射光强度 与该光线通过溶液或物质后的透射光强度比值的对数 DNA 和RNA的纯度可以通过测定260nm,230nm和280nm的紫外吸收值来测定 一般来说OD260代表核酸的吸光度,OD280代表蛋白质的吸光度,OD230代表其他杂质(多糖等)的吸光度 A260/280 比值一度成为判断核酸纯度的唯一通用标准 DNA及RNA纯度的判断根据OD260/OD280的比值判断 DNA的A260/A280应在1.8-2.0之间, DNA 260/2801.8说明有蛋白质污染,2.0说明RNA污染。 样品中如果含有蛋白质及苯酚,A260/A280比值会明显下降。 RNAOD260/OD280的比值应达到2.0, RNA 260/2801.8说明有蛋白质、酚的污染,2.0说明RNA降解 1.蛋白质污染:确保不要吸入中间层及有机相。减少起始样品量,确保裂解完全、彻底。加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低,则用氯仿重新抽提一次,再沉淀,溶解。 2.苯酚残留:确保不要吸入中间层及有机相。加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的 离心力和时间要足够。 3. RNA污染:建议楼主在提取的DNA中加入RNA酶,然后在测浓度,RNA会干扰DNA浓度,即使是试剂盒也不行的。 4.试验中的所有离心管和PCR管,研钵都要经过高温高压灭菌处理。 1.基因组DNA要结合电泳和测量OD两方面看,单看那个都不准确。 2.基因组DNA提取稍微有拖尾一点,是非常正常的 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- RNA及DNA的提取,260/280测定用来鉴定DNA及RNA的纯度。260/280的值在1.8-2.0之间最好。 RNA 260/2801.8说明有蛋白质、酚的污染,2.0说明RNA降解 DNA 260/2801.8说明有蛋白质污染,2.0说明RNA污染。 =============================== OD值 1.??朗伯——比尔(Lambert-beer)光吸收定律: A=-lgT=εb c A——吸光度,又称光密度“O.D”。 T——透光度, T=I / I。, I。——为照射到吸收池上的光强,I——为透过吸收池的光强。 ε——摩尔吸光系数或克分子吸光系数(L?mol-1?cm-1)。 b——样品光程(cm),通常使用1.0cm 的吸收地,b=1cm。 C——样品浓度(mol/L)。 由上式可以看出:吸光度A与物质的吸光系数“ε”和物质的浓度“C”成正比。 2.??DNA和RNA的OD值 2.1??原理 嘌 呤碱和嘧啶碱具有共轭双键,使碱基、核苷、核苷酸和核酸在240~290nm的紫外波段有一强烈的吸收峰,因此核酸具有紫外吸收特性。DNA钠盐的紫外吸 收在260nm附近有最大吸收值(图3-25),在230nm处为吸收低谷,其吸光率(absorbance)以A260表示,A260是核酸的重要性 质,RNA钠盐的吸收曲线与DNA无明显区别,蛋白质在280nm处有最大的吸收峰,盐和小分子则集中在230nm处,对于纯的核酸溶液,测定A260, 即可利用核酸的比吸光系数计算溶液中核酸的量,核酸的比吸光系数是指浓度为1μg/mL的核酸水溶液在260nm处的吸光率,天然状态的双链DNA的比吸 光系数为0.020,变性DNA和RNA的比吸光系数为0.022。据朗波-比尔光吸收定律A=-lgT=εbc知,c=A/εb,而b通常为1cm,所 以,通常以1OD值相当于50μg/mL双螺旋DNA,或40μg/mL单螺旋DNA(或RNA),或20μg/mL寡核苷酸计算。 2.2??纯度 DNA 和RNA的纯度可以通过测定260nm,230nm和280nm的紫外吸收值来测定,纯的DNA OD260/280在1.8-1.9,OD260/230应大于2.0,纯的RNA OD260/280在1.9-2.0,如果DNA比值高于1.8-1.9,可能有RNA没有去除干净,如果DNA比值小于1.8-1.9,可能含有酚或者 蛋白质(RNA中含有酚或者蛋白质比值也会降低),若OD260/230小于2.0说明有残存的盐或小分子杂质污染。 2.3??浓度 DNA 和RNA的量,据朗波-比尔光吸收定律A=-lgT=εbc知测量样品的浓

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