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实验方案资料文档
广谱抑菌乳酸菌素的纯化及其功能基因的克隆表达研究
乳酸菌的分离、筛选及生理生化检测
1.菌种的分离
1.1样品的处理
配置250m无菌水,在操作台中将样品放置锥形瓶中。37℃摇床1小时。
1.2培养基
乳酸菌分离培养:MRS、Elliker、BS、LSA、CQ 培养基。以上培养基均在 121℃灭菌15min。
1.3菌株的分离
采用稀释平板涂布法对奶酪中的菌群进行分离,将样品用灭菌水做 10 倍梯度
的稀释,吸取10-1,10-2,10-3三个稀释度,取悬液0. 2 mL 分别涂布于5种固体平板上, 每个梯度稀释液涂布4个平板, 分 2 组置于有氧和厌氧条件下, 37℃培养1-2d, 转接划线培养2次将保存的菌种放至35℃冰箱恒温箱中培养,待菌落外形无较大变化进行液体富集。在无菌操作台上挑取特征明显,生长旺盛的菌落接种至以灭过菌的15mlMRS液体培养基试管中,37℃,培养24h。观察菌液浑浊取出,在无菌工作台上,取培养好的菌液于1.5mlEP管中以备提取DNA,另取菌液进行镜检。
1.4革兰氏染色
将已分离出的600株乳酸菌进行革兰氏染色初步确定为乳酸菌
洗片→少许菌苔→晾干→结晶紫初染1min→水洗→晾干→碘液媒染30s→水洗→晾干→95%酒精脱色20s→水洗→晾干→番红复染→水洗→晾干→镜检。
1.5菌种保藏
对于镜检后的菌株进行甘油冷冻保藏。分别从液体培养的试管中取0.7ml菌液与0.5ml甘油混合在菌种保藏管中,摇匀后先放置在4℃冰箱中预冷24h。隔天将菌种放置-80℃冰箱中冷藏。
1.6提取菌株DNA
(1)将装有菌液的EP管置于置于离心机中12000r/min,离心5min,弃掉上清液;
(2)加入0.2mlTE缓冲液稍微震荡一下,加入0.05ml溶菌酶L,微震荡,在水浴锅中加热10min,温度55℃;
(3)取出后,先加入0.05ml蛋白酶K,再加入0.3mlSDS,放置55℃水浴锅中加热15min;
(4)取出后,加入5molNaCl0.1ml。0.08mlCTAB,混匀,放置65℃水浴10min;
(5)取出后加入0.25ml苯酚,0.25ml异戊醇混合液,12000r/min离心5min。取上清液,继续加入0.25ml苯酚,0.25ml异戊醇进行抽提,离心5min,重复2次;
(6)取离心好后的上清液置于新EP管中,加入0.02ml醋酸钠后,加入与上清液等体积的无水乙醇0.2ml。放置4℃冰箱过夜;
(7)去过夜的EP管进行离心5min,将离心管中的液体全部缓慢倒掉,继续加入0.5ml70%乙醇,离心5min,取出后继续倒掉液体,再加入0.5ml70%乙醇离心5min。将EP管晾干至无乙醇味,加入0.1mlTE缓冲液。放置-20℃冰箱保存。用于PCR扩增。
1.716S rRNA 基因 PCR 扩增和系统进化分析
应用细菌16SrRNA通用引物(正向引物271:5’-GAGAGTTTGATCCTGGGTGAG-3’,反向引物1492r:5’CTACGGTACCTTGTTACGGA-3’)进行PCR扩增。
PCR配方(25μl体系)
2μl 200μM DNTP
0.5μl Primer
2.5μl buffer(50μM KCI,100μM Tris一HCI,调PH至8.3)
0.5μl Taq酶
lμl 模板
18μl 双蒸消毒水
PCR条件:扩增过程包括:95℃下变性4min,95℃下变性30s,51℃退火
30s,72℃延伸lmin,循环35次,72℃延伸10mnin,最后4℃。30个循环。
PCR 产物纯化后,由上海生工生物科技有限公司采用用正向扩增引物直接测序。将测序结果提交到 GenBank数据库中,序列同源性分析利用BLAST在线进行。从数据库获得相关属、相关种的 16S rRNA 基因序列,建立系统发育树。
1.8 rep-PCR 指纹图谱分析(可以鉴定到种水平)
指纹图谱所采用的引物所使用的引物为:BOX-AIR:5’ -CTA CGG CAA GGC
GAC GCT GAC G-3’。 PCR扩增程序95 ℃变性30 s,40 ℃退火1min,72 ℃延 伸 2 min,35个循环,最终退火温度为72℃,5min。PCR产物经1.5%的琼脂糖分离,60V电压电泳5-6 h。所得的电泳图谱以TIFF格式保存,然后采用凝胶分析软件对rep-PCR指纹图谱进行分析。
1.9乳酸菌生理生化鉴定
参照《常见细菌系统鉴定手册》进行几种主要鉴定:
大分子物质的水解试验:
1.淀粉水解试验
无菌操作将活化好的菌种接种到灭好菌的淀粉培养基中,另做一个不接种的
平板做空白对照;将平皿密封倒置于37e恒温培养箱中培养24h;观察细菌的生
长情况,将平皿
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