小麦miRNA来源剖析.pptVIP

在这项研究中，我们使用实验方法，为小麦中存在的20个保守的miRNA家族以及23个新的miRNA提供证据。这些新的miRNA也存在于其他单子叶植物如水稻，大麦和F.草，这表明它们是单子叶植物特有的。 然而，我们无法找到在其他植物中的其余19个miRNA基因，这可能代表小麦特异性miRNA 讨论 在这项研究中，采用另一种单子叶植物，克隆到另外四个miRNA，LED的识别是特定于单子叶植物的。 miRNAs在不同种植物中有不同的表达模式 miRNA 水稻 拟南芥 小麦 156 育苗发育强 成熟组织弱 育苗发育强 成熟组织弱 在茎根旗叶高表达 159 花器官中高表达 所有组织高表达 164 叶高表达 根高表达 171 花 所有组织；根相对高 预测出的小麦miRNA靶基因可能具有广泛的生物学功能 最近的研究表明，miRNAs在拟南芥，水稻和其他植物物种的转录编码蛋白时参与不同的生理过程。本研究中，预测出46条靶基因，有三分之一是具有不同功能的转录因子，eg：MYB, NAC, ARF, HD-Zip，其他的则参与编码一些蛋白，eg：Argonaute蛋白，TIR1，天门冬氨酸型内肽酶/酶等 植物miRNA的靶基因只有一个单一的miRNA互补的位点位于编码区和偶尔在3’或5’。本研究中，有11条位于3’，有2条位于5’ 小分子RNA的克隆是了解他们在不同生物体的数量、多样性和可能的作用的起点。 本研究发现的58条miRNA属于43个miRNA家族，其中有20个已知miRNA家族，和23个新发现的家族。 结论 结论 重要的是，我们已经确定了四个单子叶植物miRNA。进一步的研究表明，一些miRNA的差异表达在一个组织或发育阶段依赖性。这项研究第一次大规模克隆小麦miRNA及其表征提供了预测目标，作为未来的功能研究奠定了基础。 “ ” “ ” 小麦的miRNA来源 报告人： 学号: 目 录 microRNA 实验材料与方法 结果 讨论 结论 MicroRNAs (miRNAs) 4,361 miRNAs Caenorhabditis elegans 非编码单链RNA，20~22nt， 调节蛋白编码基因在真核生物中的表达 独立的转录单位 miRNA及其靶点在植物生长发育的各个方面都有基本功能的调节作用，在营养剥夺，生物和非生物反应胁迫中也有重要作用。 miRNA识别方法 克隆和小RNA库的测序：已知miRNA、一些新植物物种的miRNA 已知miRNA计算预测：已知miRNAs 植物材料： Triticum aestivum L. 75%的相对湿度、26 /20°C昼夜温度、光照强度3000 LX的室内培养。 建小RNA库：取培养30天的幼苗叶片和根和孕穗期的穗。 表达分析：取幼苗的根和叶，拔节期的茎，穗，其穗下节间和孕穗期的旗叶。 实验材料与方法 数据分析：PHERED、CROSS MATCH programs、BLASTN RNA 凝胶印记分析 miRNA表达的半定量RT-PCR确认 实验路线 小RNA库共有262955条序列，其中长度在18-26nt的有25453条。 结果 miRNA与其他小RNA区分的特点：具有适应miRNA周围序列的发夹结构。 确定新的小麦miRNA 小麦中保守的miRNA鉴定 miRNA丰度的表达 根据已知我们的搜索，为20个miRNA预测出30条假定靶基因；为12个新miRNA预测出16条假定靶基因；还有11种新miRNA无法预测靶基因 小麦miRNA靶基因的预测 “ ” “ ”