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CompleteGeneListsofExpressionProfiles表达谱基因完整列表
Complete Gene Lists of Expression Profiles
This file presents the complete expression profiles derived from different breast cancer microarray datasets. In each table, ‘ID’ is the Unigene accession of a gene while ‘Name’ is its symbol. ‘Count’ represents how many times a gene was ranked within top-100 by re-samplings, and ‘Weight’ is the Z statistic of a gene obtained from Wilcoxon Rank Sum Test (RST) applied on the data of all patients in corresponding dataset. Table 1-3 separately give the 60-gene list derived from two independent breast cancer datasets and their combination. These lists represent gene expression profiles corresponding to 3-year recurrence outcome of breast cancer and the list in Table 3 is recommended by this study. The counts are based on 10,000 re-samplings.
Table 1 The Reporter List Derived from Rosetta Breast Dataset
ID Name Count Weight Hs.523468 SCUBE2 9991 6.57 Hs.445000 PTGER3 9463 5.51 Hs.148767 RQCD1 9432 -5.4 Hs.352962 LOC285086 9248 -5.09 Hs.496068 PCTK1 8768 -5.12 Hs.520974 YWHAG 8743 -5.05 Hs.9589 UBQLN1 8723 -5.15 Hs.433512 ACTR3 8537 -4.74 Hs.20013 SYF2 8213 4.66 Hs.268787 ARIH1 8119 -4.7 Hs.84113 CDKN3 8114 -4.64 Hs.514527 BIRC5 8079 -4.55 Hs.439200 KIAA0090 8012 4.7 Hs.2006 GSTM3 7915 4.55 Hs.380164 KRTAP4-7 7855 -4.72 Hs.30743 PRAME 7646 -4.68 Hs.429 ATP5G3 7590 -4.52 Hs.547509 SMARCE1 7577 4.62 Hs.55028 CENPN 7396 -4.35 Hs.482233 DEPDC1B 7038 -4.25 Hs.473648 GART 6862 -4.39 Hs.521012 FLJ21062 6852 4.29 Hs.567410 PSMD14 6549 -4.2 Hs.469649 BUB1 6547 -4.2 Hs.35096 ? 6383 4.14 Hs.495728 PIR 6144 -4.12 Hs.79353 TFDP1 6035 -4.11 Hs.155204 ZNF174 5950 4.12 Hs.591190 PEX12 5771 4.07 Hs.518475 EIF4A2 5679 -4 Hs.492618 EXT1 5652 -4 Hs.173162 COX4NB 5647 -4 Hs.592317 TGFB3 5644 4.02 Hs.547696 NUP155 5636 -4 Hs.512963 ALG11 5492 4 Hs.128425 C19orf29 5463 4 Hs.153752 CDC25B 5249 -3.92 Hs.190518 C21orf45 5246 -3.92 Hs.350966 PTTG1 5204 -3.85 Hs.484738 MYLIP 5159 3.92 Hs.408062 KLC4 5108 3.92
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