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§4基因诱变与蛋白质工程

蛋白质工程 * * 理论上,人们可以利用基因重组技术,分离克隆出编码自然界中所有蛋白的基因,再让其再特定的宿主细胞中表达,进一步纯化出可商品化的产品。 实际上,许多天然蛋白的物理、化学性质并不适合工业生产。 所以人们利用蛋白质工程技术,对天然蛋白进行改造,进而设计、创造出新的、具有优良品质的蛋白质。 § 1 蛋白质工程简介 概念:蛋白质工程(protein engineering) 蛋白质化学 物理 通过对 蛋白质晶体学 的研究,获取蛋白质的 化学 蛋白质动力学 生物学 特性, 对编码基因进行有目的地改造 利用 表达 基因工程等手段,将其 分离纯化 最终投入使 制药 用 工业用途。 目前,蛋白质工程主要集中在对现有蛋白的改造方面。 基本步骤: 分离纯化目的蛋白 氨基酸测序、X-ray晶体衍射、核磁共振 了解该蛋白结构、功能的数据 根据其氨基酸序列,设计探针 从cDNA文库中钓出该蛋白的编码基因 对基因序列进行改造 插入合适的表达载体,导入宿主细胞,表达 分离表达产物,检测蛋白活性 对于一些了解不清的蛋白质,若要改进,可遵循一些经验规律: 1、疏水性氨基酸一般为活性中心区域的结构支架;Pro是结束?-helix的标志;Cys可能形成二硫键。 2、对于保守氨基酸要保护 3、保留潜在的糖基化位点(Ser、Thr、Asn),尤其对分泌蛋白、穿膜蛋白 4、对于有内含子的序列,可直接删去一个外显子或2个内含子与一个外显子的组合。 5、构建融合蛋白时,结合部位的构像要一致(?-helix对 ?-helix) 6、随机插入6bp接头,产生2个氨基酸,可以鉴定功能性结构域 7、不在天然存在的RE识别位点进行缺失突变,以防破坏ORF。 § 2 基因诱变 基本概念: 寡核苷酸介导的诱变(oligonucleotide-directed mutagenesis),又称定点诱变(site-specific mutagenesis),是指在DNA水平上改变氨基酸的编码序列。 诱变的前提条件: 了解要改变的基因编码区的精确的核苷酸序列 了解要引入的氨基酸变化 最好能了解蛋白质的三级结构 诱变的结果: 改变一个特定的核苷酸,进而改变一个氨基酸 对一段最可能引起蛋白质功能变化的基因进行随机突变,产生一系列突变蛋白 § 2·1 用M13 DNA 进行的寡核苷酸介导诱变 假设要将Ile改造成Leu,即将ATT 改造成CTT + ATT - TAA ds M13 载体 RE RE T4 DNA 连接酶 重组子 导入大肠杆菌,产生噬菌斑 分离出+ssDNA 大量引物( GAA ) 低温、高盐 发生错配(mismatch)

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