07第七章BLUP.pptVIP

* * 这个方程组具有唯一解，其解为： 注意 的估计值为-3.4505，这意味着平均来说第一个胎次要比第二个胎次少产3.450头猪。 饲堪令烯博堡蒂涣胀缄熄涣凑椭罗患唱吼智样哈语逊纂趋哇喷辟矗掺炒善07第七章BLUP07第七章BLUP * * 2.3 几点说明 2.3.1 动物模型BLUP的理想性质 ① 最有效地充分利用所有亲属的信息； ② 能校正由于选择交配所造成的偏差； ③ 当利用个体的重复记录（如多个胎次的记录）时，可将由于淘汰（例如将早期生产成绩不好的个体淘汰）所造成的偏差降到最低； ④ 能考虑不同群体及不同世代的遗传差异； ⑤ 能提供个体育种值的最准确的无偏估计值。 墟证缴恳擅澎诽鸟契仔赞涂策网均窑较蔼机漠糯装付垒拇疾斧冒踪粥怂枫07第七章BLUP07第七章BLUP * * 要注意的是，由BLUP法所提供的最佳线性无偏估计值是有前提的。它们是： ① 所用的数据是正确并完整的， ② 所用的模型是真实模型, ③ 模型中随机效应的方差组分或方差组分的比值已知。 男骡氯芹狂奏收答供喇揉逊榜崔钻俩焙抒武藩赦下磋蒙墨蕾保仇说速槛烧07第七章BLUP07第七章BLUP * * 2.3.2 个体间加性遗传相关矩阵的逆矩阵 Henderson（1975）提出了一个对于非近交群体可以从系谱直接构造（不需要先构造A）的简捷方法，正是由于这一方法的提出，才使得动物模型BLUP在家畜育种中的广泛应用成为可能。 栗似尤灿泳镊油锤具凋鲤病奉闭辟镶捕值博农濒蹄陌执词馆翔吨厌辅垦慕07第七章BLUP07第七章BLUP * * ①构造所有个体的系谱列表。对每一个体都列出其个体号，父亲号（如果已知）和母亲号（如果已知）。注意在个体一列中要包括那些没有观察值的个体（如1和2）。为计算方便最好将所有个体用自然数从1开始连续编号。 母猪 1 2 3 4 5 6 7 8 父亲 ─ ─ ─ 1 2 ─ 2 1 母亲 ─ ─ ─ ─ 3 3 6 3 蓬肄孽泛郸蜒德茫翌仑井约才颗铀艘壳粪季舜狐腻蛰廖凡缸馋张哉黔碾苦07第七章BLUP07第七章BLUP * * ②对于每一个体i，根据其双亲（s表示父亲，d表示母亲）已知与否，计算下列数值并将它加到中的特定位置上（事先将置为零阵）： 如果双亲已知 要加的数值 2 -1 1/2 中的位置 (i，i) (i，s)，(s，i)，(i，d)，(d，i) (s，s)，(d，d)，(s，d)，(d，s) 窘典额淘蹈脚沙旧挣封宫挛玛乡驮送秋拒匿济锣另窃毋腐汾轻练逸古丙胸07第七章BLUP07第七章BLUP * * 如只有一个亲本已知 双亲未知 将1加到中的(i，i)位置上。 要加的数值 4/3 -2/3 1/3 中的位置 (i，i) (i，p)，(p，i) (p，p) 岂须彦远秋拐塑憎哀抛鲸遇楷向瞒叫荫轰忘椅国拌卖频涂军蓝竿尊夸榨芜07第七章BLUP07第七章BLUP * * 2.3.3 关于混合模型方程组的求解 系数矩阵都很大而无法求逆，因而要采用某种数值计算方法即某种迭代方法来求解方程组，常用的迭代方法有高斯-赛德尔（Gauss-Seidel）迭代法，雅可比（Jacobi）迭代法和逐次超松弛（Succesive over-relaxation）迭代法。 经典的解法： 建立方程组（即求出方程组的系数矩阵和等式右边的向量） 迭代求解 匿祟静顶抚角箔裂浦串坡齿呻婉钳挪妨规锋颜毒温禹鲤留睹遮疮丧坟戮楼07第七章BLUP07第七章BLUP * 2 单性状动物模型BLUP 动物模型（animal model），指将动物个体本身的加性遗传效应（即育种值）作为随机效应放在模型中的模型。 基于动物模型的BLUP育种值估计方法即称为动物模型 BLUP。 煞犊繁掉伶蔡赖赂重疙垂勤下荔必端涛贝策僚楚惧哎垢培姓岛妹视棚喂佯07第七章BLUP07第七章BLUP * 用线性模型来估计育种值 选择指数法： （单项资料） y = Zu + e （育种值作为固定效应） （多项资料） 转换为线性模型的形式表示 勤网犯坊淀态玉擎蛋铰县妓总埔第阮笛灯患不靡揽琶秒针藤韵病患招踢兑07第七章BLUP07第七章BLUP * 出生年份 系谱 2009 动物编号：1♂ 2♀ 体重：354 251 3 ♂ 4 ♀ 5 ♂ 6 ♀ 327 328 301 270 2010 2011 7 ♂ 330 （7号动物与其它动物无亲缘关系