生物软件OMIGA20中英文对照及简单介绍.docVIP

Omiga 介绍 软件下载安装 序列下载（来源于NCBI） 家猫味觉受体T1R3，mRNA（保存为fasta格式） 小鼠味觉受体T1R3（保存为gb和fasta格式） 褐家鼠T1R3蛋白序列（fasta格式） 打开软件 新建一个Project（项目） 桌面——OMIGA文件——新建001 然后导入家猫和小鼠序列信息 序列导入后 File文件菜单（以家猫为例） print setup打印设置 Save保存 edit编辑 undo复原至上一次保存后 redo重做（撤销上次操作） paste as features粘贴功能 select all 全选 invert selection反向选择 find查找（如ATCG） interpret ambiguities in search string在搜索字符串模糊查找？ Go to 到序列哪个位置 locate next selection 定位下一个选择？ options选项 view视图 complement互补链 features特点，功能 translation翻译为蛋白质序列 select reading frames选择阅读框 frames帧数 brackets括号 genetic code遗传密码 display type显示类型 rotate circular display旋转圆形显示 rotate map旋转图 restriction map限制性图谱 filter过滤 zoom放大 labeling标签 move ORF map 移动ORF到……一个 Tools工具 Create Edit Delete Feature特点功能(标注特殊片段) Commeplent互补链（所选链变为其互补链） Reverse逆转，颠倒（序列反向） Translate翻译（翻译后可保存，并可显示蛋白序列片段） Readback从指定密码子向左右读序列 composition analysis view成分分析视图 insert Ns 序列中插入N的个数 Show as RNA以RNA链的形式显示 search搜索 restriction sites限制性酶切位点 protel协议，协定 common enzyme常见，通用的酶 select enzymes选择酶 Hide user defined enzymes隐藏用户定义的酶 apply enzyme filter应用酶过滤 ambiguous sequence matches含糊的序列匹配 match all residues匹配所有残基 exclude matches with N排除插入N的匹配 exclude all ambiguities排除所有模棱两可的，有歧义的 description描述 enzymes available from most manufacturers多数厂家提供的酶 asymmetric enzymes非对称酶 symmetric enzymes对称酶 recognition site识别位点 current database当前数据库 search parameters搜索参数 all proteolytic agents所有蛋白制剂 open reading frames开放性阅读框 default默认 standard genetic code— all ORFS over 50 bases标准遗传密码都—超过50个碱基ORFS proteolytic sites蛋白水解位点 nucleic acid motifs核酸模体，基序 search parameters搜索参数 protocol协议 eukaryotic regulatory真核监管，法规 fungal真菌 metal binding金属结合 prokaryotic regulatory原核监管 viral病毒 ZINC finger锌指（一种常出现在DNA结合蛋白中的一种结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成，形成的结构像手指状。锌指结构由一个α-螺旋和两个反平行的β-折叠三个肽段组成。） YGTGTTYY加尾信号及转录终止信号：在加PolyA尾位点的上游10～20bp处，常见一保守的AATAA序列，为加尾信号；而具有PolyA尾基因的终止信号是G/T簇，其通式为：YGTGTTYY。 yeast termination酵母终止子 Hide user隐藏用户 allow mismatches允许不匹配 description描述 strands to be searched要搜索的链 database数据库 cu