1-中南大学高性能计算集群应用培训试卷.ppt

中南大学高性能计算集群 应用培训 陈伟 chenwei@ 曙光信息产业（北京）有限公司 技术支持中心 CLI登录 Hostname： Username： test 请登录,查看说明，下载软件 文件传输 登录地址与用户 等与CLI登录相同 与FTP的区别： security FTP 使用端口22 应用实例 上传cas文件 上传dat文件 编辑软件脚本文件 vi fl5l1.jou file/read-case-data ../fl5l1.cas.gz solve/iterate 10 parallel/timer/reset solve/iterate 25 parallel/timer/usage yes exit yes exit 脚本学习方法： file/write/start journal，指定脚本文件名1.jou file/write/stop journal，将全部操作写入到1.jou 编辑PBS作业脚本 vi fl5l1.pbs #!/bin/bash #PBS -N fluent_16cpu #PBS -l nodes=2:ppn=8 #PBS -j oe NPROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE` cd $PBS_O_WORKDIR fluent 3d -t$NPROCS -cnf=$PBS_NODEFILE -g -i fl5l1.jou fluent_16cpu.out 作业提交： qsub fl5l1.pbs 作业状态查看： qstat -f 算例输出 tail -f fluent_16cpu.out 图形窗口： 打开vncserver test@node64:~ vncserver New X desktop is node64:6 Starting applications specified in /public/home/ceshi/test/.vnc/xstartup Log file is /public/home/ceshi/test/.vnc/node64:6.log test@node64:~ 窗口操作：与windows下操作完全一致 查看结果文件 （文本） ansys应用 命令行方式 ansys110 图形方式 launcher110 ansys： 准备输入文件： DB文件 resume,input,db,,, /solu SOLVE apdl文件 /PREP7 K,1,0,0,0, K,2,2,0,0, K,3,2.3,0.2,0, K,4,1.9,0.45,0, K,5,1,0.25,0, LSTR, 1, 2 LSTR, 5, 1 FLST,3,4,3 FITEM,3,2 FITEM,3,3 FITEM,3,4 FITEM,3,5 BSPLIN, ,P51X, , , , ,-1,0,0,-1,-0.25,0, FLST,2,3,4 FITEM,2,1 FITEM,2,3 FITEM,2,2 apdl文件来源：ansys命令行窗口 pbs提交文件 #!/bin/bash #PBS -N ansys_test #PBS -l nodes=1:ppn=8 #PBS -j oe cd $PBS_O_WORKDIR rm host.list -rf for node in `cat $PBS_NODEFILE` do echo -e MPI_REMSH=/usr/bin/rsh -h $node -np 1 ansysdis110 -dis -mpi HPMPI done host.list ansys110 -dis -mpifile ./host.list -i ansys_test.inp -o ansys_test.out 作业提交 qsub ansys.pbs 作业状态 qstat qstat -f 996 作业输出与算例输出 file.db ansys_test.o996 ansys_test.out 错误处理 1、文件格式的问题 2、计算节点状态 3、license 4、请求资源 接下来培训内容： Linux操作系统初级培训 Linux环境下程序开发基础 作业管理系统（PBS） CAE-CFD应用与解决方案 CAE-CFD应用高性能集群实例分析