2016-7-反转录-病毒规范.ppt

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RecF途径 recB-或recC-突变后导致重组频率下降到野生型的1%。所以,在sbc+菌株中99%的重组通过RecBC途径进行,只有1%通过RecF途径。 外切酶I 把RecF重组途径的中间产物导向RecBC途径,因此,在recB- recC- sbcB+ 菌株中,RecF途径不能有效地发挥作用。在recB- recC- sbcB- 突变型菌株中,外切核酸酶I失活,中间产物不能转向RecBC途径,此时,RecF途径能起作用,重组频率回复正常。 (supresson of recB and recC, sbc) * RecE途径 sbcA-突变型菌株中,多了一种不依赖ATP的核酸酶。这种酶对单链DNA只有少量活性,对双链DNA活性较高,不具有内切核酸酶活性。此酶成为外切核酸酶Ⅷ,由recE基因编码。sbcA是其抑制基因。 recB-recC- sbcA+ 菌株中,无外切核酸酶Ⅷ, 重组频率低。 recB-recC- sbcA- 菌株中,有外切核酸酶Ⅷ, 重组频率回复正常 * * 重组修复的分子机制 * 第五章 转位重组 转座因子(transposon,Tn): 基因组内不必借助于同源序列就能 改变自身位置的一端DNA序列. 转座(位)重组发生在非同源序列间,不 需RecA蛋白 * 第一节 细菌转座因子的类型和结构 一 插入序列 二 细菌转座子 复合转座子 复杂转座子(TnA转座子) 三 细菌转座因子的插入机制、转座模型 * 1  原核生物转座因子的发现 McClintock提出转座(Transposition)和跳跃基因(jumping gene) 1967年Shapiro才发现了转座因子(transposable element)。 E.coli 半乳糖操纵子(gal K,T,E )中发现了一种极性突变。 有以下的特点: (1) 能回复突变;排除缺失突变 (2) 用诱变剂对其处理并不能提高回复突变率; 他们想到galE-的突变可能也是部分DNA的插入(突变)和切离(回复突变)所致。 * * 证实转座因子的实验: (1) 密度梯度离心实验 (2) 分子杂交实验 * * ?dgl+/ ?dglm 杂合双链DNA的电镜照片。 * * 2 .细菌转座因子的类型 (一) 插入序列(IS) (二) 复合转座子 (三) TnA家族 (四) Mu噬菌体  (五)接合型转座子 * * * * * * * 3.转座机制 (1) 剪-贴型转座 (2) 复制型转座 (3) 保守型转座   (4) 接合型转座 * 剪-贴型转座 * * 复制型转座机制  以细菌中转座子Tn3为例,说明转座的一般过程 (1979年Sharpiro提出) : A. 切开: 转座酶识别受体的靶序列,在两条单链上均切开,形成粘性末端;识别自身的反向重复序列,在3‘端切开。 B. 连接:供体和受体结合形成不完整共联体,留下缺口。 C. 复制:DNA聚合酶补齐缺口,再连接形成完整的共联体(共整合体),具有重复序列。 D. 重组:在特定位点进行重组,共联体分离:留下原来的转座子;并在靶序列上插入转座子,两端有同向重复序列。 * * 复制型转座 Sharpiro Model * 复制型转座模型能够解释: (1) 复制性转座在转座后原来的位置上保留原有的Tn; (2) 在新位置上转座子的两端出现正向重复靶序列; (3) 转座过程中出现共整合体。 * 保守型转座 * 接合型转座子 * * * * 基因重组是生物体在未发生突变的情况下,产生新的遗传型个体的现象。 杂交: 是遗传类型不同的个体相互交配或结合,产生杂种的过程。 * Mzostak 双链断裂修复模型 * 2 大肠杆菌的同源重组 单链取代模型 recBCD途径 recF途径 RecE途径 * * 单链取代(single-strand uptake) 单链入侵( single-strand invasion)   由RecA催化单链取代。 RecA有两个完全不同类型的活性: (1)在SOS反应中它能具有蛋白酶活性--位点专一性、内切 (2)能启动DNA单链和与之互补的双链分子进行碱基配对。   *  由RecA催化单链取代 (单链同化)  可发生在各种形状的DNA分子之间,但要具备3个条件 (1)其中一个DNA分子要有单链区; (2)其中一个DNA分子要有游离的3末端; (3)单链区的3’末端可和另一DNA分子互补。   * * *

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