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2 主要核酸操作技术
核酸凝胶电泳技术
核酸分离技术
PCR技术
mRNA的纯化和文库的构建
基因克隆技术
DNA序列分析技术
突变位点的检测
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主要内容
遗传标记
DNA遗传标记
基因突变
SNP
SNP检测技术
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遗传标记
遗传标记:形态学标记、细胞学标记、生化标记、分子标记
分子标记(Molecular Markers)
广义:可遗传并可检测的特异DNA序列、RNA或蛋白质。
狭义:指DNA或RNA标记。
DNA遗传标记:指以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接的反映。
DNA遗传标记的种类(P436):
限制性片段长度多态性RFLP、简单重复序列(SSR)、SNP。
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DNA遗传标记(P437)
第一代标记: 限制性片段长度多态性(RFLP)
定义:用限制性内切酶特异性切割DNA链,由于DNA的一个“点”上的变异所造成的能切与不能切两种状况,可产生不同长度的片段,可用凝胶电泳显示多态性。
优点:广泛用于检测已知DNA点突变,可以检测大到几千个碱基对DNA片段;对SNP位点检测和基因分型均能较准确的判断。
缺点:限制性酶切过程中不可避免的遭遇到酶切不完全或DNA降解的现象,且只能检测已知多态位点,不能罕见的或未知的突变位点;每次酶切2-3个片段,信息量有限;限制性内切酶价格较昂贵。
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DNA遗传标记
第二代标记:简单重复序列(SSR)
定义:真核生物基因组中散布有由大量由简单重复序列所组成的微卫星和由串联重复短序列组成的小卫星。在小卫星或微卫星的两端往往是相对保守的限制性内切酶位点。通过特异性引物进行PCR扩增、凝胶电泳和放射自显影(或银染),可以检测到在简单重复序列中由于重复单位数不同而造成的DNA区域的多态性。
优点:与RFLP标记相比SSR检测的多态性频率高得多。
应用:基因定位、DNA指纹分析、遗传分析和疾病诊断等。
缺点:要克隆足够数量的SSR并进行测序,需要投入足够的资金、人力和时间。
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DNA遗传标记
第三代标记:SNP
定义:基因组DNA序列中单个核苷酸的突变引起的多态性。
SNP是基因组中最简单、最常见的多态形式,具有很高的遗传稳定性。
已经在人类基因组中发现了超过1000万个SNP位点,平均约每300bp就有一个SNP。
绝大多数SNP位于非编码区。
优点:可用于检测未知突变;可以与DNA芯片技术相结合实现自动化检测。
缺点:存在假阳性和假阴性;检测效果受检测条件影响。
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DNA遗传标记
依据DNA遗传标记进行基因分型。
P473基因型(genotype):
人:除性染色体外,人类细胞内的染色体都有两份,一个人所拥有的一对等位位点的类型被称为--。
泛指:同一基因座位上多个等位位点的
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