DNA分子标记技术在乳酸菌多态性研究中的应用.PDFVIP

微生物学通报 AUG 20, 2008, 35(8): 1297~1301 Microbiology ? 2008 by Institute of Microbiology, CAS tongbao@ * 通讯作者：Tel: 0471-4309230; : jinyeyc@ 收稿日期：2008-01-13; 接受日期：2008-03-21 专论与综述 DNA分子标记技术在乳酸菌多态性研究中的应用 剧 柠 靳 烨* (内蒙古农业大学食品科学与工程学院 呼和浩特 010018) 摘 要: 本文概述了常用于乳酸菌分离鉴定及多态性研究中的基于 rDNA 序列的分子标记技术和 几种 DNA指纹图谱技术(RAPD, ARDRA, AFLP, REP/ERIC-PCR), 并对这些技术的原理、方法及 其近几年在乳酸菌研究中的进展进行了介绍。同时本文还比较了各种方法的优缺点, 不同的研究 方法, 其分辨率和检测限不同, 必须根据研究目的, 选择合适的分析方法。 关键词: 乳酸菌, DNA标记技术, 分类, 鉴定, 多样性 The Application of Molecular Marking Technology in Diversity Research of Lactic Acid Bacteria JU Ning JIN Ye* (Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018) Abstract: This paper outlines some molecular marking technology based on rDNA sequences and several DNA fingerprinting technology (RAPD, ARDRA, AFLP, REP/ERIC-PCR) used in classification, identifica- tion and diversity research in lactic acid bacteria. The principles, methods and progress in recent years of these technologies were also introduced. At the same time, this paper also compares the advantages and dis- advantages of these methods. People should choose suitable method according to their purposes. Keywords: Lactic acid bacteria, DNA marking technology, Classification, Identification, Diversity 对人类具有益生作用的乳酸菌越来越多地受到 了世界营养学家和临床学者的关注。这些有着丰富 生态多样性的乳酸菌作为食品添加剂和生物治疗药 物所表现出的潜在益生特性近年来也越来越多地得 到人们的重视。对这些微生物正确地鉴定是评价其 安全性的第一步。然而, 传统上对微生物的鉴定分 类是利用形态学和生理学特征及其差异来进行的 , 难以保证分类的准确性和科学性, 不能正确反应微 生态, 使微生物资源大量丢失[1]。随着分子生物学的 快速发展, DNA 标记技术为乳酸菌的快速鉴定和分 型提供了借鉴。本文介绍几种主要应用于乳酸菌分 类鉴定及其多态性研究中的 DNA标记技术。 1 基于 rDNA序列的分子标记技术 1.1 16S rDNA序列同源性分析 原核生物核糖体 r R N A 含有 3 种类型： 23S rRNA、16S rRNA、5S rRNA, 它们分别含有约 2900、1540和 120个碱基。rRNA的结构既具有保守 性, 又具有高变性, 所以其测定成为目前鉴定细菌基 因性状关系应用技术中最具权威性和准确性的检测 方法之一。60年代末, Woese通过比较各类生物细胞 的核糖体 RNA 特征序列, 认为 16S rDNA 及其类似 1298 微生物学通报 2008, Vol.35, No.8 /w