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遗传图绘制

教材:杨金水. 基因组学(第二版)北京:高等教育出版社,2007 参考书:T.A.布朗著,袁建刚译著,基因组(3rd 版)北京:科学出版社,2009 结构基因组学 结构基因组学:基因组计划 功能基因组学 功能基因组学:后基因组学(postgenomics) 利用结构基因组学提供的 信息和产物,在基因组系 统水平上全面分析基因的 功能的一门学科。 比较基因组学 比较基因组学:研究不同物种之间在基因组结构和功能方面的亲源关系及其内在联系的学科。 PLoS?ONE:大量非灵长类动物基因组数据受到了人类DNA的污染 2011-2-18 15:23:23 2月16日发表在《公共科学图书馆 综合》 PLoS ONE 期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因组数据受到了人类DNA的污染。 样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因。这一研究报告引起了生物研究人员及各大权威媒体的高度关注,《科学家》 The Scientist 杂志以及《自然》 Nature 杂志均在其官方网络上第一时间对这一事件进行了报道。 第2章 遗传图绘制 结构基因组的研究策略 为何要绘制遗传图与物理图 2.1 遗传图谱与物理图谱 1)遗传作图(Genetic mapping):采用遗传学分析方法将基因或其它DNA序列标定在染色体上构建连锁图。这一方法包括杂交实验,家系分析。遗传图距单位为厘摩(cM), 每单位厘摩定义为1%交换率。 2)物理作图(Physical mapping):采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因组实际位置。物理图的距离依作图方法而异,如辐射杂种作图的计算单位为厘镭(cR), 限制性片段作图与克隆作图的图距为DNA的分子长度,即碱基对(bp, kb)。 最早发现的DNA分子标记—RFLP:由于同源染色体同一区段DNA序列的差异,当用限制酶处理时,可产生长度不同的限制性片段 RFLP:restriction fragment length polymorphism, 限制性片段长度多态性 RFLP是如何发现的? 在犹他州盐湖城滑雪胜地艾尔塔的一场例行的学术讨论中, 从事经典人类遗传学研究的专家与从事分子生物学研究的专家进行学术交流。分子生物学家从经典遗传学的研究中获得灵感。 David Botstein David Botstein开创核酸限制性片段 长度多态性分析技术,用于标志不同 个体间的基因差别,为后来的人类基 因组计划奠定了基础。 PRINCETON, N.J. -- Princeton University has named David Botstein, a renowned geneticist, educator and pioneer of the Human Genome Project, as the new director of the Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics. 第1篇有关人类RFLP实验论文 A Highly Polymorphic Locus in Human DNA Arlene R. Wyman and Ray White, MIT A locus in the human genome, not associated with any specific gene, has been found to be a site of restriction fragment length polymorphism. The polymorphism was found by hybridizing a 16- kilobase-pair segment of single-copy human DNA, selected from the human genome library cloned in phage CH4A, to a Southern transfer of total human DNA digested with EcoRI. DNAs from a number of individuals from within Mormon pedigrees as well as random individuals have been examined. The locus is highly vari

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