研一数量的数量遗传学概述.docVIP

《数量遗传学》第三、四章读书报告 专业：作物遗传育种 学号：学生：吴章东 《数量遗传学》第三章为遗传交配设计，主要介绍了常用的一些遗传交配设计的原理、方法和参数估计，并提出在估计出群体的遗传参数后，如何应用这些参数指导育种实践。第四章为配合力分析，详细介绍了基于双列杂交设计的配合力分析及其在实践中的广泛应用。在经过了第三、四章的学习后，我对数量遗传学有了更进一步的了解，特别是配合力分析，对育种实践具有很好的指导意义。 在第三章遗传交配设计中，可以利用引证群体准确估计遗传参数，这是数量遗传研究的基础与关键。这些遗传交配设计应满足两个基本条件：1.二倍体群体,包括近交群体到非近交群体；2.能用统计方法进行分析,且易于分析和解释。本章主要介绍了如下一些最基本的交配设计，包括双亲本设计（BIP设计）、NC设计（北卡罗林设计，包括NCⅠ、NCⅡ、NCⅢ设计）、三重测交法（TTC）和双列杂交设计。 其中，我对NC设计有一定的理解。具体分析如下：NC设计主要用于估算群体的两个重要遗传参数，即加性方差DR和显性方差HR，同时还能估算环境方差E，从而可以进一步估算基因型方差、平均显性度和遗传率等遗传参数，阐明群体某些性状的遗传结构和遗传方式。所得结论一般可以推广到整个群体，但不能用于指导育种中特定亲本的选配。 NC设计的前提条件有以下三点：1.试验所用的父本或母本材料是从两个纯系杂交产生的F2群体中随机选择的。2.在一定的时间或空间内构成一个试验环境的随机样本。3.检测性状不存在非遗传的母体效应。 NCⅠ设计 利用试验设计产生一个亲本相同而另一个亲本不同的半同胞子代，这样既可以提供半同胞协方差等统计量。NCⅠ设计可以满足这种需要，它又称为巢式设计。它以F2代或者以随机交配的高代群体作为基础群体，随机选出一些个体作为父本，再随机选若干个体作为母本，有多少父本就有多少母本组，每个母本只交配一次，各母本组的个体不仅组内不同，组间也各异。 其数学模型为：Yijk=μ+fi+mij+eijk 方差分析为： 变异项目 df MS EMS 重复 r-1 父本间 f-1 MS1 σ2+rσ2m/f+rmσ2f 母本间（父本内） f（m-1） MS2 σ2+ rσ2m/f 试验误差 （r-1）（mf-1） MS3 σ2 可得: σ2=1/4DR+3/16HR+EW(家系内方差) σ2f=1/8DR(CovHS半同胞协方差) σ2m/f=1/8DR+1/16HR+Eb(父本内母本间方差) 后二者之和为遗传方差σ2B=1/4DR+1/16HR(CovFS全同胞协方差) 三者之和为表型方差σ2P=1/2DR+1/4HR+Eb+Ew 当Eb=0时,DR=σ2f8,HR=16(σ2m/f-σ2f),Ew=σ2-2σ2f-3(σ2m/f-σ2f) 如令HR=0,则：DR=8σ2f=8σ2m/f，Ew=σ2-2σ2f 当Eb≠0时，在估计值中，HR偏高，EW偏低；如令HR=0，则EW和Eb均被高估。解决办法为：1.按单株随机安排试验；2.在同一环境中将子代家系进行重复以估计环境方差Eb；3.解求无公共环境效应和G*E影响的协方差。 在NCⅠ设计中，方差估计最明显的特征是：相对于加性方差DR和环境方差EW而言，显性方差HR的估计值显得较大。原因是在拟合模型时未考虑环境效应Eb和母性效应M，而是简单地假设环境效应为0，忽略母性效应。一般来说DR的估计值能保证无偏，但HR被高估16（Eb+M），而EW被低估3（Eb+M）。因此，若能保证Eb为0，或提供Eb的估计值，对于符合加-显模型的性状，NCⅠ设计非常适用。 NCⅡ设计 该设计只进行f个父本的父本组，m个母本的母本组的组间两两交配，组内品种不进行交配，即各母本组的个体组内不同，组间相同。这样产生的后代家系每一个体间都是半同胞关系，即要么有共同的父本，要么有共同的母本。 其数学模型为：Yijk=μ+fi+mj+（fm）ij+bk+eijk 方差分析为： 变异项目 df MS EMS 重复 r-1 父本间 f-1 MS1 σ2+rσ2mf+rσ2f 母本间 m-1 MS2 σ2+rσ2mf+rσ2m 父本*母本 （f-1）（m-1） MS3 σ2+rσ2mf 试验误差 （r-1）（mf-1） MS4 σ2 可得：σ2m=1/8DR σ2f=1/8DR σ2mf=1/16HR+Eb σ2=1/4DR+3/16HR+EW 前两者为半同胞CovHS，前三者为全同胞CovFS。 同NCⅠ设计一样，NCⅡ设计中DR的估计值能保证无偏，但HR被高估，而EW被低估。 对NCⅠ设计和NCⅡ设计来说，它们所提供的关于HR的信息均比DR和EW少，而且亲子协方差的存在与否对于DR有显著影响。由于试验设计中