化学编辑排版及分子模拟计算.pptVIP

第二章 化学编辑排版和分子模拟计算;主要内容;第一部分：化学结构绘制软件; 在撰写一篇化学论文时，除了文字描述、公式、图表外，化学结构式是少不了的，但目前的文档编辑软件都不具有这一功能，必须借助专门的软件来完成化学结构式的绘制。 现在微机上经常使用的绘制分子结构的软件为ChemWindow, CS Chemoffice, ISIS Draw 和ChemSketch 等。HyperChem, WebLab ViewerPro, ArgusLab 和RasMol等可用于绘制或浏览3D分子结构。; 大多数的化学结构式绘制软件还具有显示3D结构的功能，象Chemoffice和Chemwindows还具备一定的分子性质计算功能，如分子中的键长、键角、偶极矩及各原子上的电荷密度分布等。为更加直观地表示分子的特性提供了便利的工具。 当然还有专门用于量子化学计算的软件如：HyperChem、Gauss98win等，可在一些著名的国内院校FTP服务器上下载试用，若要用于文章发表，必须用正版软件，否则侵权。 ; 仅就化学结构式的绘制而言，各软件的功能大同小异，差别主要体现在软件提供给用户可用的结构式模板的多少，因为模板可为用户绘制复杂结构式提供便利。如各类氨基酸结构的绘制，DNA结构等。这里主要介绍Chemwindow6.0的使用，并与其它类似软件提供简单的说明与比较。;Chemwindows6.0简介;Chemwindows6.0工具栏;Chemwindows6.0工具栏;Chemwindows6.0工具栏;Chemwindows6.0工具栏;Chemwindows6.0工具栏;;化学键的绘制;化学键的绘制;化学键的绘制;;与环有关的工具;与环有关的工具;与环有关的工具;与划箭头有关的工具; e) 按Shift 键，拖动鼠标可以改变箭头长度 f) 拖动鼠标可产生90 度箭头，单击端点可改变箭头类型、拖动端点可改变两端的长度和方向，按Shift 键拖动箭头的各端点可改变箭头形状，其操作与弯箭头类似。 ;与划箭头有关的工具;与划箭头有关的工具;1) 化学符号标记( ) ;课堂作业：以“班级+姓名+日期”为Word文档的名字，提交到本人邮箱;2) 文字说明Caption( ) ;编辑工具;编辑工具;编辑工具;编辑工具;编辑工具;编辑工具;划框、括号及划线工具;划框、括号及划线工具;3) 划线及编辑工具( ) ;;轨道符号;;组合工具;组合工具;组合工具;其它工具;其它工具;其它工具;附加库使用;附加库使用;菜单命令;菜单命令;菜单命令;菜单命令;菜单命令; Chemwindow做为化学结构式绘制软件广泛应用于各大学化学专业中，至今已从Chemwindow3.0发展到Chemwindow6.0，是专门为化学工作设计的、用于化学反应式及结构简式绘制的应用程序。Chemwindow3.0与其它类似程序相比,具有体积小、功能全的特点，基本上可满足一般化学反应式的需要，而且操作简单，使用方便，在熟练掌握其操作的基础上，其它类似的软件即能做到触类旁通。Chemwindow3.0的主窗口如下图所示：;工具模板简介;工具模板简介;插入原子工具，可以在光标指定位置插入相应的符号与文字，若标签栏是打开的，则符号应先在其中输入，然后将光标移至需插入的位置即可，若标签栏是关闭的，则可直接在光标处输入相应的符号与文字，此时输入数字被默认为是下标，输入正、负号则默认为是上标。;插入文本工具，可在光标处插入相关的文字，并可通过Size、Style菜单改变其大小与字体等。 弯箭头工具可产生各种形状的弯箭头，是所有弯箭头工具中最方便的一种，用户只需用鼠标拖出箭头的起点与终点，其中间弯曲部分由两个控制点来任意调节。拖动箭头部分可改变箭头的位置，拖动尾部则可改变箭尾的位置。;化学键工具可产生单键双键与叁键，直接拖动产生单键（每一个基本结构至少有三个控制点，分别在两端与中间，鼠标指向时显示一个黑色的方块■），将鼠标置于该键的中心控制点上再单击则变为双键，再击一次变为叁键，若再击则变回单键。;工具模板简介;工具模板简介;工具模板简介;工具模板简介;作业练习;;;