湖南大围子猪SLADR基因克隆及其生物信息学分析的论文.docVIP

　　湖南大围子猪SLADR基因克隆及其生物信息学分析的论文 【摘要】 目的: 研究湖南大围子猪sladr基因特性, 评价该猪种在异种器官移植中是否具有应用前景。方法: 应用rtpcr扩增大围子猪sladra和sladrb基因, 插入pucmt载体, 双向测序, 用ncbi中的blast和expasy软件进行生物信息学分析。结果: 大围子猪sladra和sladrb基因扩增片段大小分别为1 177 bp和909 bp, 均包含完整的开放阅读框, 分别编码252和266个氨基酸残基。生物信息学分析结果表明, 大围子猪sladra和sladrb与人类相应的dra、 drb相比, 氨基酸同源性分别为82%和73%。sla dr α链与人cd4 分子结合部位介于第124 至136 位氨基酸, 大围子猪sladra在该结合区域与人类相应的dra存在两个氨基酸差异, 即: 第127位(lle→val), 第136位(ser→thr); sla dr β链与人cd4 分子结合部位位于第134至148位氨基酸, 大围子猪sladrb在该结合区域与人类相应的drb相比氨基酸序列完全相同。与国际genbank 已登录的许多猪种相比, sladra基因同源性高达100%, 而sladrb基因在各猪种之间具有很高的多态性。结论: 克隆湖南大围子猪sladra和sladrb基因, 该基因与人类相应的hladra和hladrb基因高度同源, 提示该猪种有望作为异种移植的候选供体。 【关键词】 sladr基因; 湖南大围子猪; 基因克隆; 异种移植 cloning and bioinformatics analysis of sladr genes in hunan dap; gene therapy center, third xiangya hospital of central south university, changsha 410013; 2department of animal science and technology, hunan agriculture university, changsha 410128, china 　　[abstract] aim: to evaluate the potential of da pigs to humans by analyzing the characteristics of sladr genes in hunan daethods: sladra and sladrb genes plified by rtpcr, cloned into pucmt vectors, sequenced and analyzed through blast in ncbi and related softe (orf) and encode 252 and 266 amino acids respectively. paring the sladra and sladrb genes an, the homologies of amino acid sequences ino acids in sla dr α chain of da position 124 to 136, an cd4, shoino acids in sla dr β chain of da position 134 to 148, an cd4, orphism ology of sladra gene is up to 100%. conclusion: the cloned sladra and sladrb in hunan daorphism an, indicates that dae advantages as xenotransplantation dnors from pigs to humans. 　　[keyajorhistopatibility plex, mhc), 又称作猪白细胞抗原(shc同源性较高的猪种将有助于提高异种移植物在人体内的存活时间, 为临床大规模开展将猪器官或细胞异种移植到人提供理想的供体猪种来源。 　　中国具有丰富的猪种种质资源, 不同的地域分布形成了猪种的多样性和遗传的相对稳定性, 为异种移植提供了可贵的研究和利用资源[4]。湖南大围子猪是我国特有的地方猪种之一, 亦是湖南省著名地方优良猪种, 具有繁殖力强、 抗逆性强、 耐粗饲、 肉质好、 生长慢、 饲料效率高等种质性状。但是, 大围子猪能否作为异种移植的供体, 尤其是该猪种细胞表面sla特性如何, 目前尚不清楚。本研究将克隆湖南大围子猪sladr基因, 分析其sla