纳米工程中大规模分子动力学仿真算法的研究进展.pdfVIP

维普资讯 学兔兔 第44卷第2期 机 械 工 程 学 报 v。1．44 No．2 2008年 2月 CHINESE JOURNAL 0F MECHANICAL ENGINEERING Feb． 2008 纳米工程中大规模分子动力学 仿真算法的研究进展水 唐玉兰 胡 适 王东旭 赵健伟 梁迎春2董 申2 (1．南京大学化学化工学院 南京 210093； 2．哈尔滨工业大学机电工程学院 哈尔滨 150009) 摘要：综述了借助分子动力学仿真方法研究纳米工程领域中的单晶材料纳米压痕、拉伸、切削和磨削，非晶材料的纳米压痕 和多晶材料的塑性变形等方面。介绍提高单机仿真规模的Verlet列表法、Cell Linked链表法、网格邻近列表链表法和列表势 等串行算法，还描述原子分解法、作用力分解法和空间区域分解法等通过增加CPU的数量使仿真规模得到大大提高的并行 算法。同时，从串行算法和并行算法两方面对国内外学者在该领域的研究现状进行较全面的综述。虽后，指出目前的分子动 力学仿真规模还不足以满足需求，仿真算法还需本质上的突破。 关键词：分子动力学仿真算法 纳米工程 串行算法 并行算法 中图分类号：TP301．6 Development of Research in Large-scale Molecular Dynamics Algorithm for Nan0-engineering TANG Yulan HU Shi WANG Dongxu ZHAO Jianwei LIANG Yingchun DONG Shen (1．College ofChemistry and Chemical Engineering，Sanjing University,Sanjing 210093； 2．School of Mechatronics Engineering，Harbin Institute of Technology,Harbin 1 50009) Abstract：The researches on nano-engineering by the molecular dynamics simulation method are reviewed，such as nano·indentation， nano-tensile，nano-cutting and nano—grinding of single—crystalline，nano—indentation of am orphous materials and plastic deformation of polycrystalline．Serial algorithm which improves performance on one computer and paralleled algorithm which enhances the simulation scale ofthe system by running on multi-CPUs are introduced．The former includes Verlet table，Cell-Linked list,Verlet cell-linked list and Tabulated potential method and the lager includes atom decomposition，force decomposition and spatial deco m— positio