生物信息学分析培训班-linux常用命令.docx

Linux常用命令命??令：man功能说明：查询命令用法语??法：man commandExample?：man ls?查询ls?命令的用法1.?目录和文件管理1.1目录相关1.1.1? mkdir功能说明：建立目录语??法：mkdir [-p]? dir1 [dir2 …]参??数：-p?若所要建立目录的上层目录目前尚未建立，则会一并建立上层目录。Example?：mkdir testdirmkdir -p newdir/childdir1.1.2rmdir功能说明：删除（空）目录补充说明：该命令只能删除空目录，若要删除非空目录，请使用rm –r dirname语??法：rmdir [-p]? dir1 [dir2…]参??数：-p删除指定目录后，若该目录的上层目录已变成空目录，则将其一并删除。Example?：rmdir testdirrmdir -p childdir1.1.3ls功能说明：列出目录内容语??法：ls? [-alhtr]file/dirname参??数：-a??显示目录下所有文件和目录（显示隐藏文件和目录）。-l??显示文件/目录详细信息，每行显示一个文件/目录。-h?文件大小按’K’，’M’，’G’，来显示（需要加-l??参数）。-t??用文件和目录的更改时间排序。-r?反向排序Example?：ls? -a dirnamels -lh dirnamels -ltr dirname补充说明：ll?并不是linux?下的基本命令，实际上是ls–l??的一个别名（缩写），别名可在~/.bashrc中使用alias定义，如alias ll=’ls –l’1.1.4cd功能说明：切换目录语??法：cd dirnameExample?：cd? /path/dirname/特殊例子：cd /??转换到根目录cd ~?转换到家目录（即/home/yourname/）cd ../?转换到上一级目录?cd -??转换到上一次cd前所在的目录1.1.5pwd功能说明：显示工作目录绝对路径语??法：pwdExample?：pwd特殊目录的表示：/??根目录~??家目录./??当前目录../??上一级目录特殊说明：linux?下以”.”开头的文件名为隐藏文件，使用ls? -a时才会显示1.2文件处理1.2.1? touch功能说明：创建一个空文件或者更改文件修改时间语??法：touch filenameExample?：touch newfile创建一个名为newfile的空文件1.2.2cp功能说明：复制文件或目录语??法：cp [-r] source file/dirname destination file/dirname参??数：-r/-R?将一个目录及目录内所有文件复制到另一个目录Example?：cp file1file2?将file1复制并重命名为file2cp file1 file2 dirname/??将file1，file2复制到一个目录下cp -r dir1 dir2??若dir2已存在，dir1复制到dir2下，若不存在，dir1复制并重命名为dir21.2.3mv功能说明：移动或更名现有的文件或目录。语??法：mv source file/dirname destinationfile/dirnameExample?：mv file1file2?将file1重命名为file2mv file1 file2 dirname/?将file1，file2移动到dirname/目录下mv dir1 dir2??若目录dir2已存在，dir1移动到dir2下，若dir2不存在，dir1移动并重命名为dir21.2.4rm功能说明：删除目录或文件语??法：rm? [-r]? file1/dir1 [file2/dir2 …]参??数：-r/-R??删除目录和该目录下的所有文件Example?：rm? file1 [file2 …]????删除file1[file2 …]rm -r dir1 [dir2 …]??删除dir1 [dir2 …]?目录及目录下所有文件1.2.5less功能说明：查看文件内容语??法：less [-SN] file1 [file2 …]参??数：-S??每行不显示长于屏幕宽度的字符（默认显示在下一行）-N?显示行号Example?：less? -S file??less -SN file补充说明：使用less?打开文件后，使用ctrl+u向上翻页，ctrl+d向下翻页，/pattern可以进行向下匹配查找，?pattern可以进行向上匹配查找。使用“q”退出。1.2.6more功能说明：显示文件内容语??法：more file1 [file2…]Example?：more file补充