公共数据库应用及转录组生物信息分析20121120长征医院转化医学中心.pptxVIP

公共免费数据库应用及转录组生物信息分析;全球共享数据的利用价值;NCBI GEO; NCBI-GEO数据库 GEO = Gene Expression Omnibus (基因表达精选集) EBI-ArrayExpression数据库 EBI = 欧洲生物信息研究所;;;;;;;;;;;;Lncrna db;Lncrna db;搜索功能;;;在不同物种中的定位;小鼠ncRNA表达数据库;;与蛋白相互作用;其他的一些lncRNA数据库;生物网络分析;更广泛的疾病调节网络;非タンパクコードRNAを利用した医薬開発;;;适用数据 差异基因 差异蛋白 miR靶基因 拷贝数变异片段所含基因 相互作用关系数据库 KEGG Reactome Biogrid HPRD BIND;蛋白质相互作用关系 激活、抑制 磷酸化、去磷酸化 结合、解离 泛素化 糖基化 甲基化 代谢通路的上下游关系 基因表达调控关系 表达激活 表达抑制 ;;共表达网络(Dynamic-GeneNet/GenRelNet);;;基因表达若干种现象;基因表达的若干种现象; pre-mRNA 剪接; pre-mRNA 剪接; pre-mRNA