模拟失重对大肠杆菌K12基因表达及表型的影响.PDFVIP

微生物学通报 May 20, 2017, 44(5): 1038−1046 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160107 研究报告 模拟失重对大肠杆菌 K12 基因表达及表型的影响 1 1 2 1 2 2 1* 容丹 王佳平 王海立 高建义 韩延平 杨瑞馥 李勇枝 (1. 100094) (2. 100071) 摘 要：【目的】通过低剪切力模拟失重(Low-shear modeled microgravity ，LSMMG)连续传代培 养大肠杆菌，检测大肠杆菌在模拟失重条件下的表型变化及基因改变。【方法】利用旋转细胞培 养系统模拟失重环境对大肠杆菌 K12 进行连续传代培养，对菌株进行增殖速率、耐酸性和生物 膜形成的测定，以此评估LSMMG 对大肠杆菌K12 表型的影响。利用转录组测序检测模拟失重 条件下差异表达的基因，与表型作比对。【结果】模拟失重导致大肠杆菌增殖速率降低，耐酸性 下降，生物膜形成能力增强；模拟失重条件下，营养代谢相关差异表达基因有25 个，其中20 个 表达下降，2 个与耐酸相关基因表达均下降。【结论】模拟失重会引起大肠杆菌表型及相应的基 因变化，其中生物膜形成能力的增强可能对航天飞行造成潜在威胁。 关键词：模拟失重，大肠杆菌，转录组测序 Effect of microgravity on Escherichia coli K12 phenotype and gene expression RONG Dan1 WANG Jia-Ping1 WANG Hai-Li2 GAO Jian-Yi1 HAN Yan-Ping2 YANG Rui-Fu2 LI Yong-Zhi1* (1. Astronaut Center of China, Beijing 100094, China) (2. State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) Abstract: [Objective] To reveal the phenotypic and gene expression change of Escherichia coli after exposure to microgravity. [Methods] Rotary cell culture system (RCCS) was used to simulate microgravity environment. The effect of microgravity on E . coli K12 was estimated by measuring the growth kinetics, acid resistance and biofilm formation. RNA-Seq was applied to detect the change of gene expression under low shear mode