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实验五 目的片段的回收
实验四、目的片段的回收
学习掌握从琼脂糖凝胶电泳中回收DNA片段
一、实验目的
二、实验原理
琼脂糖凝胶是通过氢键的作用,因此过酸或过碱等破坏氢键形成的方法常用于凝胶的再溶化,像NaClO4(高氯酸钠)能用于凝胶的裂解,一般的凝胶回收试剂盒利用的也是这一原理。试剂盒采用经典的硅胶膜技术,其纯化原理是含有目的片段的琼脂糖凝胶溶解后,硅胶膜柱在高盐和低pH值条件下高效可逆的吸附体系中的DNA片段,蛋白及其他杂质不被吸附而被除去,被吸附的DNA片段在低盐和高pH值条件下再被洗脱纯化。
四、仪器设备
五、实验用具
电泳仪 微型电泳槽
紫外透射检测仪
恒温金属浴
冰盒 微量离心管 移液器 手术刀
微量离心管(1.5 ml1) 吸管头若干
三、实验材料
上次实验课Hind III酶切的MP3质粒
六、试剂
琼脂糖
0.5TBE电泳缓冲液
10 载样缓冲液 (loading buffer)
GoldView I型核酸染色剂 (10000 )
DNA分子量标准(DNA marker):Marker III
DNA凝胶回收试剂盒(广州东盛生物科技有限公司)
七、实验步骤
1、配制1.5%的琼脂糖凝胶,选择较大的梳子。
2、酶切MP3质粒的电泳分离(使用新的电泳缓冲液)。
3、切取含有目的DNA片段的琼脂糖凝胶条带(800-900 bp条带)。
4、其余步骤按照试剂盒说明书进行。
试剂盒操作步骤
1、切取含有目的DNA片段的琼脂糖凝胶条带(切下后切成小块),放入一个称重过的1.5 ml离心管里,称取凝胶的重量近似的确定其体积。
2、按照每100 mg琼脂糖凝胶对应100 l 溶液BD的比例,向离心管中加入溶液BD。
3、55-65℃恒温金属浴上温育凝胶7-10 min,直至凝胶完全溶化,期间需要振荡混合3次。
4、待溶解后的凝胶溶液降至室温时,将其置于DNA纯化柱中,静置2 min。
5、12000 rpm离心1 min,若溶液量大于DNA纯化柱的容积(700 l ),可分两次离心,弃滤液。
6、加入500 l 溶液PE,12000 rpm离心1 min,弃滤液。重复此步骤一次。
7、 12000 rpm离心3 min,以彻底去除纯化柱中的液体。
8、将DNA纯化柱置于新的1.5 ml离心管里,向纯化柱的中央悬空滴加30 l 溶液Eluent(60℃预热),静置2 min, 12000 rpm离心1 min,管底溶液即为回收的目的DNA片段。之后将DNA储存于-20 ℃保存备用。
注意事项
1、电泳时要试用新鲜配制的TBE缓冲液和新配制的琼脂糖凝胶。
2、 挖含目的DNA的凝胶时,尽量减少周围凝胶的带入,提高DNA回收率。
3、切胶时,尽量使用长波长UV(360 nm),且尽量减少DNA在紫外光下的暴露时间,以防DNA损伤。
琼脂糖必须完全融化,以免堵塞柱子,严重影响DNA片段的回收效率。
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