Gene Ontology(GO)简介及使用介绍.pdfVIP

Gene Ontology(GO)简介与使用介绍 1.GO 怎么就出现了？ 现今的生物学家们浪费了太多的时间和精力在搜寻生物信息上。这种情况归结为生物学上定义混乱的原因：不光 是精确的计算机难以搜寻到这些随时间和人为多重因 素而随机改变的定义，即使是完全由人手动处理也无法完成。举 个例子来说，如果需要找到一个用于制抗生素的药物靶点，你可能想找到所有的和细菌蛋白质合成相 关的基因产物， 特别是那些和人中蛋白质合成组分显著不同的。但如果一个数据库描述这些基因产物为“翻译类”，而另一个描述其为 “蛋白质合成类”，那么这无疑对于计算机来说是难以区分这两个在字面上相差甚远却在功能上相一致的定义。 Gene Ontology (GO)项目正是为了能够使对各种数据库中基因产物功能描述相一致的努力结果。这个项目最初是 由 1988 年对三个模式生物数据库的整合开始：: FlyBase (果蝇数据库 Drosophila),t Saccharomyces Genome Database (酵母基因组数据库 SGD) and the Mouse Genome Database (小鼠基因组数据库 MGD)。从那开始，GO 不断发展扩大，现在已包含数十个动物、植物、微生物的数据库。 GO 的定义法则已经在多个合作的数据库中使用 ，这使在这些数据库中的查询