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R语言 第二章R语言的向量操作 2.1 基本运算 2.2 数据对象 2.3 向量赋值及基本操作 2.4 矩阵的操作 2.5 文件读写 2.3 矩阵的操作 数据输入和计算的基本形式。 dim()函数,提取维度(行列数)。 nrow()提取矩阵行数 ncol()提取矩阵列数 合并向量 rbind()按照行合并,列数相同 cbind()按照列合并,行数相同 as.vector()将矩阵转为向量。 dimnames()提取行列名,赋值 rownames()提取行名,赋值 colnames()提取列名,赋值 矩阵访问 矩阵名[下标] apply()函数 apply(X,MARGIN,FUN) MARGIN中1表示行,2表示列 FUN表示算法 列表 一种特殊的对象集合,它的元素可以为各种不同的类型。 数据框 数据框属于特殊的列表形式,列表成员向量、因子、数值型矩阵、列表等(每个元素必须有相同的行列数)。 as.data.frame()转换成数据框 is.data.frame()判别是否为数据框 数据框的调用 Lapply函数(返回列表) Sapply函数(返回数据框) 2.5文件的读写 文件的读 read.table()读取纯文本 read.table(file,header=FALSE,sep=“\t”,row.names) csv格式数据(使用excel保存出) read.csv(file,header=FALSE,sep=“\t”,row.names) 用法基本与read.table一样 data()查询base包中的数据集。 data(数据名)调用数据包。 文件的写 write.table(x,file=“路径”) 保存csv格式数据 write.csv(x,file=“路径”) 用法基本与write.table一样 控制流 分支函数 if/else if(条件格式)命令else命令 if(条件格式)命令else if(条件格式)else switch switch(expr,list) expr取值在1~length(list)之间,则返回对应值,如果不在则不返回。 终止循环 break强行中止循环,跳出循环。 next继续执行,但是不执行任何命令。 循环 for(1 in 1:n){命令} 从1~n执行n次。 while(条件){命令} 条件不为0则继续循环 repeat{命令}依靠break跳出循环 简单的程序设计 函数定义 funname-function(arg_1,arg_2…){命令} 无参函数funname-function(){命令} 课堂作业 自行熟悉本堂课讲的各种命令。 * 同学们,开始上课。在讲今天的内容之前。请同学们先说一下对网络的认识。 提问:哪位同学能回答一下什么是网络呢? 简单来讲网络就是通过设备,将不同的主机连接,从而达到信息的共享,用以方便人类的生活。 今天我们就来学习一下生物世界的网络,分子生物网络。 * 同学们,开始上课。在讲今天的内容之前。请同学们先说一下对网络的认识。 提问:哪位同学能回答一下什么是网络呢? 简单来讲网络就是通过设备,将不同的主机连接,从而达到信息的共享,用以方便人类的生活。 今天我们就来学习一下生物世界的网络,分子生物网络。
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