植物数量性状基因的定位和克隆.pdfVIP

植物学通报Chinese Bulletin of Botany 2007, 24 (4): 553-560, .专题介绍. 植物数量性状基因的定位与克隆 张磊,张宝石* 沈阳农业大学农学院, 沈阳 110 16 1 摘要 作物的许多重要农艺性状属于数量性状,鉴定和发掘控制数量性状的基因及其优异的等位变异,并使之快速应用于育 种实践是新时期作物科学家和育种学家所面临的重大课题。本文从QTL作图、QTL的精细定位与图位克隆、QTL近等基因系 和染色体片断代换系的建立以及基于LD的关联分析等方面对植物数量性状的研究进展进行了讨论,提出了以植物基因组学技 术为平台,将QTL作图与关联分析方法相结合,是进行数量性状遗传机理研究同时服务于作物育种实践的有效途径。 关键词 关联分析,基因发掘,QT L克隆,QT L作图,数量性状 张磊,张宝石 (2007). 植物数量性状基因的定位与克隆. 植物学通报 24 , 553-560 . 作物的许多重要农艺性状如产量、品质和抗性等 即QTL 定位(QTL mapping)。自1998 年Paterson 第 都是数量性状,由多个基因控制,表现为连续变异,且易 一次应用RFLP连锁图谱在番茄中定位QTL 以来,QTL 受环境影响,相对于由单基因控制的质量性状而言,其遗 定位研究已经在水稻、玉米、小麦、大豆、大麦、 传基础更为复杂。经典的数量遗传学理论把控制数量 番茄和马铃薯等许多重要作物中展开,并且进展迅速。 性状的基因作为一个整体来研究,认为数量性状是由许 QTL分析的一般程序包括: (1)选择在目标性状上差异明 多作用相等的微效基因共同影响,通过建立遗传模型和 显的亲本进行杂交,建立分离群体;2)检测分离群体中个( 估算遗传方差、遗传力和选择响应等统计参数来描述 体或株系的标记基因型和表型性状值; (3)通过统计分析 和预测数量性状的遗传规律。许多经典的数量遗传学 找出与表型值相关的等位变异的标记位点。目前使用 模型已经在育种实践中发挥了重要作用。然而,在“微 的分离群体主要包括F 、BC 、DH 和RILs 等。使用 2 效多基因”理论中,影响数量性状的具体基因永远不会 这类群体定位的QTL范围一般在10-30 cM之间,并且 被发现,数量性状变异的分子生物学机理更不会被阐明 QT L 位置的置信区间一般都在10 cM 以上( 阮成江等, (Mauricio, 2001) 。随着生物技术的发展和分析方法的 2003),这一精度还不足以将数量性状确切分解成一个个 改进,尤其是分子标记技术的出现,人们对于数量性状的 孟德尔因子,因此称为QT L 的初级定位(prima ry o r 认识从 “多基因”发展到了数量性状基因座 coarse QTL mapping)。 (quantitative trait loci, QTL)分析,从而对数量性状遗传 机理的认识上升到了分子水平。 2 QT Ls 的精细定位与图位克隆 1 QTLs的初级定位 发现并分离隐藏在QT L 中的优异等位基因,使之应用 于作物品种改良和种质资源研究,是进行QT L分析的 控制数量性状的基因在基因组中的位置称为数量性状基 最终目的。植物基因组学原理和方法的建立为人们 因座(quantitative t rait loci, QT L) 。利用分子标记进 克隆QT L 提供了有力手段。到目前为止,已经有18 行遗传连锁分析,可以检测出QTL,并估算其效应大小, 个植物的QT L被成功克隆(表1),其中大部分采用了图 收稿日期: 2006- 12-08; 接受日期: 2007-04- 13 * 通讯作者。E-mail: baoshizhang@ 126 .c