CAPS标记技术与其应用进展.pdf

．-——74．-—— 江苏农业科学2011年第39卷第5期 邢廷豪，周延清，楚素霞，等．CAPS标记技术及其应用进展[J]．江苏农业科学，2011，39(5)：74—76 CAPS标记技术及其应用进展 邢延豪，周延清，楚素霞，郭静佩，周鹏，范念斯 (河南师范大学生命科学学院，河南新乡453007) 摘要：酶切扩增多态性序列(CAPS)标记技术是一种简单、经济、可靠和共显性的技术，适用于生物研究的许多方 面。本文综述了该标记技术的原理、过程、特点和在植物、动物和微生物的基因分型、分子标记辅助选择育种、品种鉴 定、分子标记的开发、基因鉴定、基因定位、遗传图谱构建、基因分离、体细胞杂合植株的遗传鉴定与分析诸方面应用的 新进展，并展望了其应用前景。 关键词：CAPS；DNA分子标记；品种鉴定；遗传图谱；基因 中图分类号：S一1 文献标志码：A 文章编号：1002—1302(2011)05—0074—03 分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础 异性的PCR引物(19～27 bp)，然后用这些引物扩增该位点 的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接反映…。广义的 上的某一DNA片段，接着用专一性的限制性内切酶切割所得 分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。蛋 扩增产物，凝胶电泳分离酶切片段，染色并进行RFLP分析。 白质标记包括种子贮藏蛋白和同工酶以及等位酶。狭义的分 1．2 CAPS的步骤 子标记只是指DNA分子标记，DNA分子标记是指能反映生 物个体或种群间基因组中某种差异特征的DNA片段。它能 够直接反映基因组DNA间的差异。 录号为L43920．1 4．0。设 随着分子生物学技术的发展，DNA分子标记技术也迅速 foa2一J基因的碱基序列，利用计算机软件，DNAMAN 发展，现已有数十种分子标记，如RFLP、AFLP、STS、CAPS、 SCAR、SSR、SNP、RAPD、ISSR、TRAP等，它们被广泛应用于遗一3’，下游引物5 传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构 扩增：利用设计的引物从大豆基因组DNA中扩增大豆的 建、基因克隆等方面怛J。不同的分子标记有不同的优缺点， 脚2一J基因；(4)酶切：利用DNAMAN4．0软件分析，发现在 015 其主要的应用也不尽相同。CAPS是酶切扩增多态性序列标fo,12一J基因的499bp和1 bp处有2个限制性内切酶 记技术，主要是对PCR扩增的DNA片段进行限制性酶切分(SeaI)位点，利用该限制性内切酶(S∞I)对PCR扩增产物 析H】，具有共显性、位点特异性、操作简单和成本低等优点， 进行酶切；(5)琼脂糖电泳分离与鉴定：用琼脂糖凝胶对酶切 广泛应用于植物基因分型、定位、克隆、分子鉴定H1和动物的 产物分析，检测其多态性。 遗传多样性、品种鉴定以及微生物的连锁图谱和品种鉴定”1 2 CAPS的特点 等方面。目前本实验室正在开展大豆油酸脱饱和酶基因的 CAPS标记及其多样性研究。本文对CAPS标记技术研究进(1)引物与限制性内切酶组合非常多，增加了揭示多态 展进行综述，以期对科研工作者提供一些参考。 性的机会，而且操作简便，可用琼脂糖电泳分析；(2)在真核 生物中，CAPS标记呈共显性，即可区分纯合基因型和杂合基 1 CAPS的原理及步骤 因型；(3)所需DNA的量很少，且对DNA的浓度要求不严 1．1 CAPS的原理 格；(4)使用的引物较长，扩增的结果比较稳定且避免了