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微生物学通报 OCT 20, 2008, 35(10): 1538~1543
Microbiology © 2008 by Institute of Microbiology, CAS
tongbao@
研究报告
氧化亚铁硫杆菌铜代谢基因Afe0329
的转录子鉴定及分析
罗焱杰 廖荷欢 张成桂 管 昊 罗海浪 刘学端* 邱冠周
(1. 410083)
(2. 410083)
摘 要: 采用 reverse transcriptase PCR 技术, 研究了嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus fer-
rooxidans)标准菌株 ATCC23270 中铜代谢基因 Afe0329 的转录子情况; 用 Vector NTI 、Blast 、
TMHMM Server 和PSORTb 等软件对此转录子中的各基因做了进一步的生物信息学分析; 并用此
转录子的引物扩增多种细菌DNA, 以鉴定此转录元件在A. ferrooxidans 菌株基因组中的普遍性。
结果表明基因Afe0329 , Afe0330 和Afe0331 一起转录, 处于同一个转录子; 基因Afe0329 为编码定
位于膜上P1b3 型ATP 酶基因, Afe0330 为编码定位于细胞质中的蛋白基因, Afe0330 和Afe0331 的
Blast 分析都没有意义的同源性序列; 且此转录元件普遍存在于A. ferrooxidans 菌株基因组中。
关键词: 氧化亚铁硫杆菌, P 型ATP 酶, 铜代谢, 转录子, Reverse transcriptase PCR
Identification and Analysis of Afe0329 Transcripton Relative
to Copper Homeostasis in Acidithiobacillus ferrooxidans
LUO Yan-Jie LIAO He-Huan ZHANG Cheng-Gui GUAN Hao
*
LUO Hai-Lang LIU Xue-Duan QIU Guan-Zhou
(1. School of Resources Processing and Bioengineering, Central South University, Changsha 410083)
(2. Key Laboratory of Biometallurgy of Ministry of Education , Central South University, Changsha 410083)
Abstract: With reverse transcriptase PCR, the transcripton of copper homeostasis relative gene Afe0329 in
Acidithiobacillus ferrooxians standard strain ATCC23270 was investigated. The further analysis of genes in
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