分子实验步骤.docxVIP

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分子实验步骤

报告一:克隆基因、筛选与表达 PCR基因扩增及扩增产物的回收 一、PCR扩增目的基因AKP 反应体系(50uL): ddH2O 35.7uL 2.5mmol/L dNTP 4uL 10xbuffer 5uL 引物 sense(10umol/mL)2uL Antisense 2uL 模板DNA 1uL Ex-Taq E 0.3uL(1.5U) 注:最后加酶。 配体系时的注意事项:将体系各成分加入管底;充分混匀;离心;冰上操作;保证管内无气泡;注意换枪头,防止交叉污染。 参数设定: 940C,5’ 30次 940C,1’ 变性 550C,1’ 退火 720C,2’ 延伸 720C,10’补齐 二、琼脂糖凝胶电泳分析PCR结果 1、凝胶配制: 0.8%琼脂糖凝胶 30mL (用1xTAE配) ;1.5uL GoldView;微波炉加热;倒胶插梳子;注意尽量去除气泡。 2、加样:50ulPCR扩增产物+6ul 10×loading buffer. 3、电泳:恒压80V。 4、凝胶成像仪或紫外透射仪观察记录电泳结果。 三、扩增产物的回收 1. 切胶、称胶重,每100mg胶加入700uL溶胶液,550C溶胶(一定要完全溶解)。 2. 装柱,12000rpm离心30秒,去除废液。 3. 漂洗:500uL漂洗液,12000rpm,30秒漂洗一次,去除废液,重复漂洗一次。 4. 12000rpm,2分钟,换成干净的无菌1.5mL小管。 5. 向柱子的正中央加20uL洗脱buffer或无菌水,放置5分钟。 6. 12000rpm,30秒。 7.向柱子的正中央加10uL洗脱buffer或无菌水,放置5分钟。 8. 12000rpm,2分钟。 9. SYBR检测回收产物 质粒DNA的提取及其定性定量分析 质粒DNA的提取 接含pETBlue-2质粒的单菌落于4mL含羧苄(50ug/mL )和四环素(12.5ug/mL)的LB液体培养基中,370C,190rpm振荡培养过夜; 4000rpm、离心1min,弃去上层培养液收集所有菌体于一个小指管中; 150uL溶液I悬浮菌体(旋涡混匀),室温10min ; 加入200uL溶液II(轻轻混匀!裂解时间不超过5min),室温静置菌液裂解变清; 加入200uL溶液III(轻轻混匀!),冰上静置15min质粒DNA复性 12000rpm,离心10min取上清 上清加等体积的酚:氯仿:异戊醇(旋涡混匀) 12000rpm,离心5min取上清 上清加等体积的氯仿:异戊醇(旋涡混匀) 10、12000rpm,离心5min 11、上清加2倍体积的无水乙醇(旋涡混匀),室温 30min 12、12000rpm,离心10min 13、沉淀用75%乙醇1mL洗涤两次(振荡混匀、离心) 14、12000rpm,离心5min 15、沉淀于超净台中风干 16、沉淀加入20uL RTE,600C水浴30分钟溶解 17、-200C保存 质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳分析 1%琼脂糖凝胶 20mL (用1xTAE配) 1xTAE 120mL 2uL质粒DNA + 0.5 uL 10xloading 80伏恒压电泳 结果用凝胶成像仪分析照相 质粒DNA的紫外吸收分析 质粒DNA用TE缓冲液稀释200倍(总体积300ul),测定A260和A280. 限制性酶切和链接 质粒DNA和目的DNA的双酶切 酶 切 反 应 体 系( 20 uL )管号核酸10xbuffer K ddH2O BamHI HandIII tube1目的基因 AKP 24 uL3 uL 0 uL2 uL 1 uL tube2pETBlue-2 10 uL 2 uL 5 uL2 uL 1 uL  37℃保温3小时。 酶切产物的纯化和回收 1%琼脂糖凝胶 25mL (用1xTAE配) 1xTAE 120mL 酶切DNA 4ul + 0.5 uL 10xloading 未酶切质粒DNA 2ul + 0.5 uL 10xloading Maker 5ul 80伏恒压电泳 结果用凝胶成像仪分析照相 接着进行扩增产物的回收,每100mg胶用700ul溶胶液来溶解,步骤同第一个实验中扩增产物的回收。 载体和AKP的连接 连接反应体系(20ul)目的基因AKP载体pETBlue-2 10xLigase buffer ddH2OT4DNA连接酶14ul2ul2ul

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