嗜盐古生菌AJ4中BR蛋白基因部分片段.PDF

维普资讯 ISSN l007—7626 中国生物化学与分子生物学报 2004年 2月 CN 11-3870／Q ChineseJournalofBiochemistryandMolecu1ar Biol 20(1)：55～60 — — ． ．． ． ． ．． ． ． ．． ． ．． ． ． ． ． ． ．． ． — — 嗜盐古生菌 AJ4中BR蛋白基因部分片段 和 16SrRNA基 因序列研究 许学伟¨，吴 敏 ， 阮 红¨，洪 洁 ，黄伟达 (”浙江大学生命科学学院，杭州 310027； 复旦大学生命科学学院，上海 200433) 摘要 为了研究分析新疆阿尔金 山国家 自然保护区阿牙克库木湖嗜盐古生茵物种与细菌视 紫红质 (bacteriorhodopsin，BR)蛋 白资源，对分离纯化到的极端嗜盐古生茵AJ4，采用PCR方法扩增 出其 16S rRNA基因(16SrDNA)和编码螺旋 C至螺旋 G的 BR蛋 白基 因片断 ，并测定了基 因的核苷酸序列 ． 通过 BR蛋白部分片段序列分析表明，BR蛋白中对于完成质子泵功能以及与视黄醛结合的关键性 氨基酸残基均为保守序列 ，位于膜 内侧的序 列比位于膜外侧的序列更保守；基于 BR蛋白基 因和 16SrDNA序列的同源性 比较 以及 16SrDNA序列的系统发育学研 究表 明，AJ4是 Haloarcula属 中新 成员．由此建立了一种快速筛选具有新 BR蛋白的新嗜盐古生茵的方法 ． 关键词 嗜盐古生茵，细菌视紫红质 ，16SrDNA，系统发育 中图分类号 Q78，Q93 PartialSequenceoftheGeneforaNew BR Protein，andNucleotideSequence of16SrRNA EncodingGenefrom aHalophilicArchaeum AJ4 XU Xue．wei” WU Min 卜 RUAN Hong” HONG Jie ，HUANG Wei—da ， ， ， (¨CollegeofLifeScienc ，ZhejiangUniversity，Hangzho“ 310027，China； Collegeof “砖Scienc ，FudanUniversit)，Shanghai 200433，China) Abstract Inordertostudythespeciesandbacteriorhodopsin(BR)proteinresourcefromAyakekumLakein theAltunMountainNationalNatureReserveRegionofXinjiang，astrainofhalophilicarchaeum AJ4was isolated．16SrRNA encodinggeneandapartofthegenecodingforaBR proteinfrom AJ4were amplifiedby PCR．nadthenucleotidesequencesweredetermined．TheanalysisofBR proteinfragmentshowedthatthose aminoacidresiduesinBR，essentialofrprotonpumpingandbindingtoretina1．areco