采用ChIP-DSL启动子芯片筛选Kid下游调控基因.pdfVIP

．578． 中国肿瘤临床 2008年第35卷第10期 基础研究· 采用ChIP—DSL启动子芯片筛选Kid下游调控基因 DNA 摘要 目的：前期研究发现驱动蛋白样DNA结合蛋白(kinesin—like bindingprotein，Kid)的编码基因(ki． nesin—like 4．KNSL4)在乳腺原发癌中的表达下调与患者差的预后相关。本研究的目的是筛选Kid下游调控基因．为 045个功能基因 探讨Kid在乳腺癌发生和发展中的作用机制提供依据。方法：采用染色质免疫沉淀技术和含人类20 启动子序列的Oligo芯片。筛选Kid抗体染色质免疫沉淀的DNA与芯片杂交的荧光强度。与无抗体对照比较差异达 2倍以上的基因作为Kid调控的候选基因：采用ChIP—PCR方法验证候选基因的启动子与Kid的结合；采用实时定 2．4倍；ATFv7IP和CDC25C在KNSL4siRNA干扰的乳腺癌细胞中的表迭水平较对照细胞分别下调1．6倍和5．8倍。 生物学行为。 关键词 Kid染色质免疫沉淀 启动子芯片 转录调控 IdentificationofKid GenesChIP-DSLCombinedwithPromoterMi- Target by croarray WANG Xiaoyanl，FENGYumeil，WANGYulil，LIXiaoqin91，WANGJinfen92 author：．FENG Corresponding Yumei，E-mail：ymfeng@tijmu．edu．cn of and of Medical andMolecular Institute 1DepartmentBiochemistry Biology，Cancer HospitalTianjin University，Tianjin 300060，China 2SchoolofPharmaceuticalScienceand 300072，China Technology，TianjinUniversity，Tianjin Grant NaturalScienceFoundationof support：National China studieshaveshownthata ofkinesin-like leveliscorrelatedwith Objective：Previous downregulation 4(KNSIA)mRNA inbreast ofthis wasto the ofkinesin—likeDNA cancer poorprognosis patients．Thepurposestudy identifytargetgenes to theroleofKidinthe and ofbreastcancer．Methods： bindingprotein(Kid)andinvestigate carcinogenesisdevelopment DNA KidinMDA-MB-435Scells