信息论（宿菲）基于互信息的差异共表达致病基因挖掘方法.PDFVIP

第39卷第 1期 东 南大 学 学报 (自然科学版) VoI_39 NO．1 2009年 1月 JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY (NaturalScienceEdition) Jan．2009 基于互信息的差异共表达致病基因挖掘方法 张焕萍 王惠南 卢光明 钟 元 张志强 (南‘京航空航天大学生物医学工程系，南京 210016) (南京军区南京总医院医学影像科，南京 210002) 摘要：为了挖掘基因表达数据 中的差异共表达致病基因模块，提出了基于互信息和最大团相结 合的方法．互信息用于度量基因表达谱之间的相互关系，计算任意2条基因表达谱在2种不同样 本中的互信息值，得到2个互信息矩阵M 和M ，选定2个阈值 ，和 丁2(T． )将矩阵M。和 M2二值化，并通过 ．和M2中元素的逻辑 “与”运算得到图的邻接矩阵，从邻接矩阵挖掘 出的 最大团则为差异共表达致病基因模块．将该方法