2 个玉米光敏色素C 基因的转录丰度对多种光质处理的 - 中国农业科学.PDF

中国农业科学 2017,50(12):2209-2219 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2017.12.002 2个玉米光敏色素C基因的转录丰度对多种光质处理的响应 1,2 2 2,3 2,3 2,3 2 4 2 1 2 牛骧 ，郭林 ，杨宗举 ，孙蕾 ，李红丹 ，游光霞 ，徐宏 ，孟凡华 ，佘跃辉 ，杨建平 1 2 3 （ 四川农业大学农学院，成都 611130 ； 中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081 ； 中国农业科学院研究生院，北京 100081； 4 河南省潢川县农业科学研究所，河南潢川 465150 ） 摘要：【目的】通过 NCBI 数据库获得 2 个玉米PHYC 及相关数据，并进行相关生物信息学分析。利用实时荧 光定量 PCR（qRT-PCR）分析 2 个玉米 PHYC 在玉米各器官的转录丰度，以及其转录丰度对多种光质处理、黑暗到 各种光质转换和光周期处理（长日照和短日照）的响应，为研究玉米 PHYC 在玉米幼苗去黄化与开花期的调控机制 奠定基础。【方法】采用玉米 B73 自交系为研究材料，通过 RT-PCR 分别对ZmPHYC1 和 ZmPHYC2 的全长 ORF 序列进 行克隆；借助相关软件对其进行生物信息学分析，利用 qRT-PCR 分析这两个基因在玉米各器官中的转录丰度，及 其转录丰度对各种光照处理的响应。【结果】 ZmPHYC1 和 ZmPHYC2 的全长 ORF均为3 408 bp，编码1 135个氨基酸 基序，分子量分别为 126.14 和 126.07 kD。生物信息学分析表明，玉米 phyC 蛋白可以分为 6 个功能区段：节奏 周期蛋白—Ah核转运接受蛋白—专一蛋白区段（Per-Arnt-Sim，PAS）、cGMP受激磷酸二酯酶区段（GAF）、色素区 段（PHY）和PAS相关区段（PRD，包含2 个PAS区段）、组氨酸激酶A区段和组氨酸激酶ATP酶区段，但是ZmphyC2 在PRD区段仅有一个PAS区段。氨基酸水平的系统发育树分析表明，ZmphyC1和ZmphyC2与禾本科物种phyC有很 高的一致性，且与甘蔗和高粱 phyC 的亲缘关系较近。qRT-PCR 分析表明，ZmPHYC1 和 ZmPHYC2 的表达在根和叶中 的转录丰度均较高，同时对持续蓝光和白光响应强烈；在黑暗到各种光质转换处理中，这两个 PHYC 的表达模式相 似。在黑暗转到远红光、红光、蓝光和白光的0.5 h，ZmPHYC1 和 ZmPHYC2 的转录表达均急剧上升，随后迅速下降 到自身起始黑暗时的水平以下，并上下波动。这两个基因对长日照和短日照的光周期处理也能积极响应，在长日照 条件下，2个 ZmPHYC 出现了极其相似的表达模式，均在光照和黑暗阶段各出现1个峰值；在短日照条件下，这两个 基因的表达模式差异较大，ZmPHYC1 的峰值出现在进入黑暗后6 h，而ZmPHYC2 的峰值出现在进入光照阶段2 h。【结 论】玉米phyC蛋白可以分成6个功能区段，但是ZmphyC2在PRD区段仅具有一个PAS相关区段。2个玉米 PHYC 转录 丰度具有组织特异性。在各种光质处理中，ZmPHYC1 和 ZmPHYC2 的表达模式相近，可能二者存在功能冗余，在转录水 平上前者的丰度高于后者，推测 ZmPHYC1 在玉米中起更重要的作用，并且可能二者在功能上存在分工。ZmPHYC1 和 ZmPHYC2 对各种光质和光周期处理均有较强的响应，推测二者在调控玉米光形态建成和开花中具有重要作用。 关键词：玉米；ZmPHYC；光信号转导；表达模式；光质处理 Transcription Abundances of Two Phy