发光成像生物光子学.PPT

一些应用： 缺点： 无法做层析，对图像的判断、分析很大程度上依赖于研究者的经验 发光信号弱时成像速度偏慢 提纲： 4.1 普通显微成像 透射/落射显微成像 相衬显微成像 微分干涉显微成像 暗场显微成像 荧光显微成像 4.2 激光显微成像 全内反射荧光显微成像 激光共聚焦扫描显微成像 FRET FLIM 拉曼共聚焦显微成像 4.3 非线性光学显微成像 多光子荧光扫描显微成像 二/三次谐波扫描显微成像 受激拉曼/相干反斯托克斯拉曼显微成像 受激荧光显微成像 4.4 远场超分辨显微成像 STORM/PALM STED SIM 4.5 层析(tomography)成像 光学相干层析成像(OCT) 扩散光学层析成像(DOT) 光声层析成像(PAT) 4.6 活体荧光成像 细胞器、细胞；细胞、小组织；组织、细胞；小动物、组织 √ √ √ √ End 液晶可调滤光片(LCTF，多光谱滤光片) * * * * * * * * * * * 《生物光子学》 * 《生物光子学》 * * X-CT OPT： Same principle of X-CT applied in optics 对于高散射的生物组织： 弹道光 占大多数，需要充分探测和利用 辐射传输方程： 由于生物组织的折射率分布极度不均匀，光的折反射理论无法计算其在生物组织中的传播方式，使用麦克斯韦方程组精确的求解生物介质电场分布亦不现实。因此，只能使用辐射传输方程，模拟光散射的分布。 μa：吸收系数，μs ：散射系数, v为光速， 分别为三维位置坐标、方向矢量与时间。 第一项表示光源以特定方向发射光子； 第二项表示在传输过程中遇到散射颗粒，被散射到其他的方向，并伴随着吸收的发生，造成光强的衰减；第三项表示光子会进入与离开介质； 第四项说明光子在传输过程中，还可能与从其他方向上散射来的光子重合。 J(r,s,t)：生物体内的光强分布；q(r,s,t)：脉冲光源的参数；P(s,s’)：散射角度方程。 生物介质内部的光学系数(μa , μs) 重构 若生物样品为均匀介质，则未知的光学系数较少，对于固定的波长，通常只有一个μa与μs 。对它们的求解可以视为一个逆问题。 若生物样品为非均匀介质， 正问题 DOT实验探测方式： 空间域探测 时间域探测 频域探测 DOT模拟的数值解法：蒙特卡洛仿真法 主体思想： 将复杂的问题转换为概率问题，然后使用大量的抽样实验，使得抽样结果的数学期望趋近于原概率问题。 由于每一次的抽样中，只需要考虑问题的某一部分，从而简化了问题；并利用大量抽样，以更好的涵盖问题的全部。 随机抽样原理： 假设某随机变量x的统计分布规律为p(x)，p(x)表示变量x的概率密度。变量x在区间[0, a]取值，根据概率密度归一化原理则有： 概率密度函数p(x)在区间[0, x]的取值之和为[0, 1]域均匀分布的一个随机数R，则有 积分后得到x=x(R)，即用一个均匀分布的随机数表示了满足具有统计分布规律p(x)的随机变量x。 设概率密度函数为 ，产生10000个R的随机数，利用 计算x，得到如下的柱状图，并分析拟合这10000个随机数的概率分布，得到实线的解析式为 。由此可知， 产生的随机数的概率分布很好的匹配了概率密度函数。 利用蒙特卡洛仿真法进行DOT模拟 假设从坐标系的原点位置发射光子。通常模拟的是无限细笔型光束垂直入射的情况，此时对每一个光子都有： Z=0，r=0， =0 此外，亦可根据点光源，准直激光光源，光纤光源等设定 利用蒙特卡洛仿真法进行DOT模拟 行进步长的概率可使用光在传输过程中“未被散射与吸收”的光强分布函数描述： 该式可以理解为光线传输s1距离后，未