MIER3MIER3在结直肠癌中的表达及其相关蛋白的生物信息.PDF

·1040 · doi 10.3969/j.issn. 1673-4254.2017.08.07 J South Med Univ, 2017, 37(8): 1040-1046 临床研究 MIERMIER33 在结直肠癌中在结直肠癌中的表达及其相关蛋白的生物信息学分析的表达及其相关蛋白的生物信息学分析 1，2 ，3 1 1 3 1 1，3 宋 文 ，彭 曼 ，段世玉 ，林 创 ，徐 琼 ，周 军 1 2 3 南方医科大学 南方医院病理科，放疗科，基础医学院病理学系，广东 广州 510515 摘要：目的构建基因真核表达载体并探讨MIER3对结直肠癌细胞生物学特性的影响，应用生物信息学方法对MIER3及其相互 作用蛋白进行预测分析。方法 应用Real-time PCR 及Western blot 方法检测MIER3 在8 例结肠癌及相应癌旁正常组织中 mRNA 和蛋白表达水平的差异表达；通过构建真核表达载体pcDNA3-MIER3 ，应用CCK8增殖实验、Transwell 侵袭实验检测过 表达MIER3对结直肠癌细胞株生物学特性的影响，进一步应用生物信息学方法对MIER3及其相互作用蛋白进行预测和分析。 结果 MIER3在8例结肠癌组织中其mRNA 及蛋白水平的表达明显低于相应正常癌旁组织；酶切及测序结果显示成功克隆构建 pcDNA3-MIER3 真核表达载体；CCK8增殖实验、Transwell 侵袭实验结果显示过表达MIER3 可明显抑制结直肠癌细胞株的增 殖及侵袭能力；应用模式生物果蝇相互作用蛋白数据库DIP 和基于保守的蛋白相互作用分析方法，预测NAT9 可能是MIER3 的 潜在相互作用蛋白，提示MIER3 可能与肿瘤的易感性相关。结论 MIER3 与结直肠癌增殖、侵袭密切相关，为进一步深入阐明 MIER3在结直肠癌发生发展中的作用奠定基础。 关键词：MIER3 ；增殖；侵袭；生物信息学 Expression of MIER3 in colorectal cancer and bioinformatic analysis of MIER3- interacting proteins 1, 2, 3 1 1 2 1 1, 3 SONG Wen , PENG Man , D UAN Shiyu , LIN Chuang , XU Qiong , ZHOU Jun 1 2 Department of Pathology, Nanfang Hospital , Department of Radiotherapy, Nanfang Hospital , Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences3, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China Abstract: Objective To explore role of MIER3 gene in the development and progression of human colorectal carcinoma (CRC) and analyze the proteins that interact with MIER3 using bioinformatic techniques. Methods MIER3 mRNA and protein expressions were detected in 8 CRC biopsy samples and paired adjacent tissues using real-time PCR and Western blotting. A recombinant eukaryotic expression