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PCR产物纯化
实验二 PCR产物的纯化 ;【实验原理】
本实验采用了Takara公司的 Agarose Gel DNA Purification Kit试剂盒。该试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DNA制备膜技术,具有高效、快速、方便之特点,全套操作只需30分钟便可完成。回收纯化的DNA片段纯度高,完整性好,可直接用于连接反应、PCR扩增、DNA测序等各种分子生物学实验。 ;【仪器与试剂】
一、实验仪器
1、琼脂糖凝胶电泳系统
2、紫外观察分析仪(波长302 nm)
3、离心机(Eppendoff)
4、单面刀片;二、【试剂】
1、TaKaRa Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0
2、50×TAE
3、ddH2O;【实验步骤】
1、使用1×TAE缓冲液制作琼脂糖凝胶,然后对目的DNA进行琼脂糖凝胶电泳。
2、在紫外灯下切出含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面的液体。
此时应注意尽量切除不含目的DNA部分的凝胶,尽量减少凝胶体积,提高DNA回收率。
注??切胶时请注意不要将DNA长时间暴露于紫外灯下,以防止DNA损伤。;3、 称量胶块重量,计算胶块体积。计算胶块体积时,以1mg=1μL 进行计算。
4、向胶块中加入胶块融化液DR-I Buffer,DR-I Buffer的加量如下表:;5、均匀混和后,75℃加热融化胶块。间断振荡混和,使胶块充分融化(约6~10分钟)。
注:胶块一定要充分融化,否则将会严重影响DNA的回收率。
6、向上述胶块融化液中加入DR-II Buffer(体积为DR-I Buffer的1/2),均匀混和。
7、将试剂盒中的Spin Column按置于Collection Tube上。
8、将上述操作6.的溶液转移至Spin Column中,3600 rpm离心1分钟,弃滤液。
注:如将滤液再加入Spin Column中离心一次,可以提高DNA的回收率。;9、 将500 μL的RinseA加入Spin Column中,3600 rpm离心30秒,弃滤液。
10、 将700 μL的RinseB加入 Spin Column中,3600 rpm离心30秒,弃滤液
11、 重复操作步骤10.,然后12.000 rpm再离心1分钟。
12、将Spin Column按置于新的1.5ml的离心管上,在Spin Column膜的中央处 加入25 μL 的水,室温静置1分钟。
注:把水加热至60℃,使用时有利于提高洗脱液效率。
13、 12.000 rpm离心1分钟,洗脱DNA。;实验操作流程图;切胶示意图;凝胶纯化结果示意图;【思考题】
1、如何有效提高凝胶纯化PCR产物的效率?
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