基于微阵列基因表达谱的一种关联空间的癌症分类算法 a relative space based cancer classification with gene expression profiles.pdfVIP

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2017-08-14 发布于上海
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基于微阵列基因表达谱的一种关联空间的癌症分类算法 a relative space based cancer classification with gene expression profiles.pdf

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基于微阵列基因表达谱的一种关联空间的癌症分类算法 a relative space based cancer classification with gene expression profiles

第4期电子学报 2008年4月 ACI’AEU日Cnl0NICASINICA 譬 №姗基于微阵列基因表达谱的一种关联空间的癌症分类算法卢新国1，林亚平2，-，王海军1，李小龙1，易叶青1 (1．湖南大学计算机与通信学院，湖南长沙410082；2．湖南大学软件学院，湖南长沙410082) 摘要：利用微阵列基因表达谱分类癌症患者样本对患者的治疗具有非常重要的意义．针对高维、高冗余的微 based Classification 阵列基因数据中致癌因子存在局部相关性的特点，提出一种基于权重的关联空间分类模型(Weight with Related Space，WCRS)．基本思想是首先利用协方差矩阵的对角化来构建癌症组的关联宅间，并提出一种基于癌症关联空间的基因表达模式，然后提取使得癌症组具有最小组能量的最小扩展空间，最后在最小扩展空间上建立一种基于权重的癌症分类算法．实验结果表明，WCRS在精确度上比传统分类算法具有更好的性能．关键词：癌症分类；基因表达谱；关联空间中图分类号：TP391文献标识码： A 文章编号：0372-2112(2008)04-614-06 ARelativeBasedCancerClassification Space withGene Profiles Expression LU 7Jn—gu01，删Ya-pin92”，WANGHai—junl，LIXiao-longI，YIYe-qinsl (1．SdtoolofComlmmandCanmuai删ion，HtmanUniversity，Changsha，Hunan410052，China； 2．洲of黝2黼，Hunan‰妇，饧嘞，‰410082，cII讹) Abstract：Classificationof wilh is c嗽lrealn七nt．Inthe redun· patientsamplesgeneexpressionprofilesiIllp删tO large dantand callcefissensitivetosoftie factorswhileanothercancerissensitive data，a h讪dimensionalgeneexpression cancerogenic others．So basedclassificationwith main isthat to翻孤Ile We a relative idea ac孤1c料’srelative proposedweight space(WCRS)．The isobta．hlcdvialbc ofitscovariance Webuiltthecancer’smodelbasedonitsrelative sp日ce diagonalization maaix，and space．Then the ofacanceris for its