花生重要农艺及产量性状的全基因组关联分析严玫.pdfVIP

植物学报 Chinese Bulletin of Botany 2015, 50 (4): 460–472, doi: 10.11983/CBB14144 ·研究报告 · 花生重要农艺及产量性状的全基因组关联分析 * 严玫, 张新友, 韩锁义, 黄冰艳, 董文召, 刘华, 孙子淇, 张忠信, 汤丰收 河南省农业科学院经济作物研究所/花生遗传改良国家地方联合工程实验室/农业部黄淮海油料作物重点实验室/ 河南省油料作物遗传改良重点实验室, 郑州 450002 摘要 通过关联分析法发掘与花生(Arachis hypogaea)产量性状显著关联、同时又在花生基因组上随机分布的SSR位点及 优异等位变异, 可了解产量相关基因区域的分布特点, 有助于利用分子标记辅助选择方法选育高产花生新品种。选用64个 SSR标记, 采用MLM (Q+K)方法对166份花生资源进行全基因组关联分析。结果表明, 通过聚类分析和结构划分, 供试群体 受其综合性状遗传特点和来源地域的影响可被划分成7个亚群, 聚类结果与群体结构基本一致, 同时群体特点与材料来源 地的生态划分符合同类聚集的规律。通过对6个产量相关性状的3年数值的关联分析, 分别发掘出SSR位点有20个、33个和 26个, 2年以上重复检出的SSR位点有13个(P0.05), 各SSR位点的表型变异解释率范围为0.011–0.348 1, 平均为0.067 3; 共检出590个等位变异, 平均每个标记位点12.29个, 表型变异解释率值最高的是与单株果数呈显著关联的位点TC1A02 (P0.001), 含 21 个等位变异 ; 与产量构成主要因子紧密关联的位点中, 百果重的TC1A02-C470 (+41.588 5) 、 TC1A02-C560 (+40.926 1)和pPGPseq2E6-B473 (+63.953 4), 单株果数的TC1A02-C500 (+7.374 4), 单株饱果数的 GM1843-E157 (+4.316 6), 可用于产量性状的分子辅助育种。 关键词 花生, 产量性状, SSR, 全基因组关联分析 严玫, 张新友, 韩锁义, 黄冰艳, 董文召, 刘华, 孙子淇, 张忠信, 汤丰收 (2015). 花生重要农艺及产量性状的全基因组关 联分析. 植物学报 50, 460–472. 花生(Arachis hypogaea)是世界上重要的油料作 2011), 利用覆盖全基因组的分子标记与合适的分离 7 2 物之一, 目前全球花生种植面积高达2.177×10 hm , 群体进行连锁分析和QTL定位以及基于连锁不平衡 年总产量3.8×107 t (FAO, 2011)。我国花生种植面积 的关联分析方法成为解析植物数量性状遗传的两类 占世界种植面积的20%, 花生产量占全世界总产量的 主要方法。 40% 以上, 2002年以来总产量一直位居世界首位, 关联分析是一种基于连锁不平衡(LD)方法检测 2012年达到1.68×107 t (FAO, 2012) 。我国是花生的 自然群体中基因位点及其等位变异, 并将等位基因变 主要生产、消费国及出口国(吴学君, 2010)。研究产 异与目标性状联系起来分析其基因作用效应的方法 量性状对稳步提高花生产量, 保障我国油料安全供给 (Mackay and Powell, 2007), 早期广泛用于人类遗传 及农民增收具有重要意义。 学研究(Templeton, 1995), 直到2001年才首次用于 传统的遗传学研究认为作物产量相关性状为数 植物遗传研究(Thornsberry et al., 2001)。目前, 已在 量性状, 由多个基因控制, 表现为连续变异,