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2017-08-23 发布于浙江
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RNA二级结构预测算法

RNA二级结构预测算法 The RNA StructurePrediction Secondary Algorithms[or 李恒武1朱大铭2 (青岛大金马摩托车有限公司青岛266510)1(山东大学计算机学院济南250100)2 Itis thetwo methodsto its structureofRNAminimalfree Abstractoneof basic predictsecondary by energy mfold this firstitS mechanismiS introduced．Thenthreemodels：nestedmodel、non— method．In predictive paper are nestedRivasmodeland are presented，the expatiated，theirdynamicprogrammingalgorithms lyngs由model their are themethodsto mfoldand virtuesand of improve lyngs审 shortcomingsalgorithmsanalyzed．Furthermore are thefore are with testedand computer，theircomparative algorithmdiscussed．Finallyalgorithmsimplemented are results presented． RNA Keywordssecondrystructure．Dynamicprogramming，Thermodynamics，NP—complete ¨ l—I 1 引言 ● na ● ● ==D曼I．…ap’8q’、 a—a ／，一 a． §钆骱吣 a_a aI-．．．a。·arf，热动力学最小自由能量方法预测RNA二级结发夹 a环堆迭多分枝环构起始于Tinoco等人[1]。1975年Pipas与Mcma— 一atI．曼I_…al·I-ai·2一、～虽十互＼玉．‰+l、 hom首先进行了最小化自由能量的计算方法的研裂…一～≥a玉n-。abq一aJtl_、／一I一7 ^”Z，．{寄”／ aj．I…a·t 究[2]，其时间复杂度为O(