Unix下EST数据库本地化更新及序列预处理分析.pdfVIP

8 1 V o l8 No1 2 0 1 0 3 Ch ina Journa l o f B io inform at ics M ar. , 20 10 Un ix EST , , , , 528000) : 利用F reeBSD 操作系统的文本过滤命令将N CB I的G enbank 数据库的EST 序列实现本地化导入到M ySQL 数据库中并能 够进 更新, 这利于对不同物种不同组织器官基因表达的分析以水稻 EST 数据为例, 对 EST 序列两端出现的 po lyA /T 和载 体序列亦进 了鉴别及去除, 经过预处理的 EST 序列数据将为进 一步进 EST 聚类及基因表达分析提供可靠的保证 : EST; M ySQL 数据库; 更新; 预处理分析 : TP392; Q 34 3. 1 : A : 1672- 5565 2010) - 0 1- 052- 05 Localization, updating and sequen ce p