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浅谈全基因组关联分析 周小青 （湖南师范大学生命科学学院 410081） 摘要 全基因组关联分析（Genome-wide association study,GWAS）是应用人类基因组中数以百万计的单核苷酸多态性（single nucleotide ploymorphism,SNP）为标记进行病例对照分析，以期发现影响复杂性疾病发生的遗传特征的一种新策略。近年来，随着人类基因组计划的实施以及基因芯片技术的发展，人们已通过GWAS方法发现并鉴定了大量与人类复杂性疾病关联的遗传变异，为进一步了解控制人类复杂性疾病的遗传特征提供了重要的线索。本文介绍了近年来全基因组关联研究在复杂疾病研究领域内的主要发现、全基因组关联研究设计原理总结了人类全基因组关联研究所取得成就和存在的问题,并对全基因组关联研究未来的研究重点和要解决的问题进行了展望。 Abstract 　Genomewide association study (GWAS) is a novel strategy for discovering genetic basis of human complex diseases , through using millions of single nucleotide polymorphism(SNPs) as marks to conduct case-control association studies. In recent years ,following the implementation of Human Genome Project and development of Genome Chips, large number of human complex diseases associated genetic variants has been identified through GWAS method,which provides important clues for understanding the mechanisms of related diseases. The present paper reviewed some common comments in whole genome association study on complex diseases, including achievements of genome-wide asso-ciation studies on complex traits or diseases, the method of GWAS，and the achievements of GWAS study. Key words Genome-wide association study（GWAS） single nucleotide polymorphism(SNPs) complex diseases 人类基因组精细图的公布，标志着现代医学的发展已逐步进入基因组医学时代。人类功能基因组学研究就是以全基因组为背景，开展人类基因及其编码蛋白的功能研究，从而尽可能全面地揭示生命的奥秘目前，基因组医学、恶性肿瘤、器官移植、精神疾病、心血管疾病、制药、医学伦理以及基因治疗等方面的重要影响已初见端倪人类基因组为药物开发提供了新源泉。[1] 。但对于复杂性疾病 ,连锁分析的作用非常有限。 复杂性疾病是指由于遗传和环境因素的共同作用引起的疾病。很久以来 ,人们已认识到大部分人类性状和复杂性疾病的产生受到多个基因和环境因素的影响 ,但是发现并鉴定这些影响“复杂性疾病 ”的遗传变异却困难重重。近年 ,随着人类基因组计划和基因组单倍体图谱计划的实施 ,研究者开始对影响人类性状形成和复杂性疾病产生的遗传特征进行了探索。短短几年内 ,已经发现并鉴定了大量与人类性状或复杂性疾病关联的遗传变异 (下图) ,为进一步了解控制人类复杂性疾病发生的遗传特征提供了重要线索[2] 。 　截至 2009年 6月, 439项 G WAS发现的与人类性状或复杂性疾病关联 SNP位点,不同灰度圆点代表不同性状或疾病 人类基因组计划完成后，国际上人类基因组的研究已经进入新阶段，技术的重大革新及其推，极大地推动了基因组医学的发展Genome-wide association study,GWAS) 是一种对全基因组范围内的常见遗传变异: 单核苷酸多态性(Singlenucleotide polymorphism