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甲壳动物免疫系统回路分析 摘要：利用构建的甲壳动物免疫系统图，运用系统生物学方法对各免疫因子的相关关系进行探讨。将免疫系统图中重要的免疫因子抽象为节点，节点之间的边代表着因子之间的相关关系，则将整个免疫系统图抽象为一个充满节点的系统网络图。通过所构建的系统网络图，寻找了两个或多个因子之间的作用机制，以及备免疫路径之间的关系；利用建立的物理数学原理来揭示因子之间的免疫反应作用机制，解答免疫中的反应现象。揭示免疫刺激剂的免疫作用机理，促进整个免疫系统的免疫水平评价。 关键词：甲壳动物；免疫回路；图论；节点 随着水广养殖业的大规模发展，养殖过程巾各种病毒和细菌对水产品产量的影响越来越严重；因此，对于怎样提高甲壳动物免疫力来抵抗病害是研究的重点。对各种免疫刺激剂如免疫多糖、巾草药等的研究越来越多，例如Deng等研究了从冬虫夏草菌丝体巾提取的多糖类物质对于凡纳滨对虾生长、免疫和抗氧化能力的影响。但仅凭几个免疫相关酶的指标来直接判断甲壳动物的免疫能力，显然不全面。甲壳动物免疫包括多条路径，如包囊作用，吞噬作用等，并且各路径之间相互影响、相互作用，一条路径的变化不能衡量整个免疫系统的能力。然而对于免疫刺激剂的研究，大部分研究都是通过测免疫指标的变化来评价的，具体的作用机理尚不清楚；例如陈吕福等研究了免疫多糖对南美白对虾免疫相关酶的激活作用。本文利用系统生物学的思想，将免疫系统网络图抽象为多节点图，利用图论的方法进行研究，并运用数学物理原理来揭示免疫因子之间或路径之间的作用机制，同时对丁免疫刺激剂的免疫应答做出重要说明。 1 甲壳动物免疫系统网络关系模型总图 甲壳动物免疫系统是一个内部相互联系、相互影响的复杂网络，其巾包括多条免疫路径：如吞噬作用、包囊作用、修复作用等。由参考义献得到甲壳动物免疫网络系统图（图1）。图中标示： 2图论分析 对于建立的全面的免疫系统图，运用图论的知识进行整理分析。1969年．Kauffman提出了著名的布尔网络(BooleanNetwork．BN)模型，用以研究基因调控网络和细胞分化过程。借助丁此类思想，通过构建网络模型来研究免疫调控网络。将甲壳动物免疫系统图抽象为一个免疫网络有向图，其巾免疫网络巾的物质及反应过程抽象为节点，免疫网络巾节点之间的关系对应图巾的边。图巾的节点和边可以带有本身的属性，边分为有向或无向的，分别代表着生化反应或免疫作用关系， 2.1 节点的出入度统计与分析 到目前为止，甲壳免疫系统巾主要免疫途径的物质及因子，可以确定下来的有51个，将其作为节点，与节点相关联的边数即为度数，输入的边数为人度，输出的边数为出度，人度与出度之和即为总度。各节点的名称及hellip;人度统计，如表l。 对丁各节点度的分布情况表（表1）．对节点度的分布进行统计分析并绘制直方图(图2和图3)。可知节点人度为l的有16个，为O的有12个；同时出度为l的有30个，只有少数的节点的出度大丁3。 构建的甲壳动物节点图巾节点数N为5l，因其不存在白连接的边和两节点问的相互边，则nr能广生的最大边数为Emax一N(N-1)，而在整个免疫网络节点图巾实际的边E为86条。则E,/Emax的结果为3.37%．由此得出，所建的甲壳动物免疫节点图是稀疏的。 对于出入度均为l的节点，在免疫路径巾不可替换，属丁具有唯一性的节点，此类节点一旦出问题，与此节点有关的网络通路将会失去作用。某一路径受阻，整个免疫系统就会受到一定程度的阻力。例如，当溶菌酶因各种因素失活的时候，整个溶菌酶杀菌系统就会切断，从而加重其他路径的压力。多个出、入度的节点，说明是免疫通路的交汇点，此类节点出现问题，就会影响多条通路，甚至引起免疫系统的瘫痪。脱颗粒作用、吞噬作用、包囊作用等免疫作用的出人度较高，属丁比较关键的节点；proPO、PO等免疫因子的出入度也高，属丁免疫系统调节的关键因子，在整个甲壳动物免疫系统巾具有重要的作用。根据实验巾的结论，PO确实在免疫过程巾充当关键的免疫枢纽的位置。 所建甲壳动物免疫网络的度分布表现为幂律形式，幂律是指节点具有的连接线与该节点的乘积是一个定值，也即是说，度数小的节点多，度数大的节点少。在所建立的甲壳动物免疫网络节点度的统计巾，频率直方图具有“长尾”现象，即节点数存在多的度数小，度数大的节点数少。高连接的节点、度数较高称为巾枢节点，在整个免疫系统的演变巾，对免疫网络各项性质起着关键性的作用，缺少了这类节点，整个免疫系统能力急剧下降，甚至陷入瘫痪。而连接数较少的节点，只能左有个别路径，在整个免疫系统巾影响范围相对较窄。 2. 2作图 通过对51个免疫节点的相关关系生成了对应的邻接矩阵，作图得到甲壳动物免疫系统网络节点图（图4）。 3 图中各种调节机制的分析 通过构建免疫系统节点问关系，揭示了各免疫因子之问的相互作用。在免疫系统节点图