玉米农田土壤细菌群落变化的dgge分析-广东农业科学.pdfVIP

广东农业科学 2013 年第 23 期 43 玉米农田土壤细菌群落变化的DGGE 分析 1 2 周 伟 黄进勇 ( 1.漯河医学高等专科学校袁河南 漯河 462002 曰 2.郑州大学生物工程系袁 河南 郑州 450001) 要 利用改进的土壤 DNA 提取方法直接从玉米农田土壤样品中提取微生物全基因组袁以嵌套式 PCR 和降 落式 PCR 扩增出细菌 16S rDNA V3 区基因袁并运用 DGGE 电泳技术对扩增片段进行分离袁对玉米生长过程中 4 个 重要生育期及不同土层深度细菌群落的变化进行了分析遥 结果表明袁改进的提取方法能够获得完整且含量较高的基 因组 DNA 袁嵌套式 PCR 有效扩增了16S rDNA V3 基因遥 随着玉米的生长以及土层深度的改变袁土壤中的细菌在保持 优势种群基本稳定的同时表现出丰富的多样性遥 其中袁在苗期和灌浆期细菌群落的变化最为明显袁细菌种类最丰富袁 而收获期细菌种类最少遥 同一生育期不同土层深度的细菌也存较大差异袁表层土壤的细菌变化最大遥 关键词 DGGE 曰 玉米农田土壤曰 细菌群落曰 多样性曰 PCR 中图分类号 S154.36 文献标识码 A 文章编号 1004-874X 2013 冤23-0043-04 Analysis of the soil bacterial community diversity in the maize field based on PCR-DGGE 1 2 ZHOU Wei 袁 HUANG Jin-yong (1.Luohe Medical Colle ge , Luohe 462002, China; 2.Bioe ngine e ring Departme nt, Zhe ngz hou Univ e rs ity, Zhe nz hou 450001, China) Abstract: Improved soil DNA extraction method was used to extract the w hole microbial genome directly from the corn farmland soil samples, the diversity of bacterial community was studied by amplify ing the bacterial 16S rDNAV3 fragment w ith nested and touch-dow n PCR methods, and separating the products by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) . Soil samples were taken at three different depths w ithin four different stages. The result show n that