酶化学B.ppt

第10章 酶的作用机制和酶的调节;一? 酶的活性中心; 酶的活性中心;（二）、?活性中心的结构特点：;频率最高的活性中心的氨基酸残基： Ser、His、Cys、Tyr、Asp、Glu、Lys。?;（三）、 研究活性中心的方法;酶的化学修饰法分类;（3）. 亲和标记法;研究活性中心的方法(续);研究活性中心的方法(动力学分析法);研究活性中心的方法(动力学分析法);研究活性中心的方法(续);定点诱变; 为验证羧肽酶A Tyr 248 在催化中的作用，对其基因进行定点突变－Tyr 248（TAT）定点突变为Phe（TTT）；实验结论是，Tyr 248 参与了与底物的结合，但不是催化所必须的，此结论必定来自如下数据： A. Kcat 突变后降低 B. Km 变大 C. Kcat/Km 升高 D. Kcat 不变 E. Kcat/Km 降低;如何确定活性部位？（习题）;（四）、酶的必需基团（自学）;1. 酶的必需基团是（ ） （1）必需基团构成具有一定空间结构的构象 （2）和底物结合幷将之转化成产物的部位 （3）抑制剂都作用于酶的活性中心 （4）所有酶的活性中心都有金属离子 2. 酶的活性中心是（ ） （1）所有的酶都有活性中心 （2）所有活性中心都有辅基 （3）酶的必需基团都位于活性中心 （4）变构抑制剂直接结 合的部位 （5）重金属沉淀酶的结合区域; 思考题; 思考题;酶高效性的机理;酶促反应的机制;（二）、 酶具有高催化能力的原因;底物与酶的邻近效应与定向效应;邻近与定向（轨道定向）效应;酶中某些基团可使底物分子的敏感键中某些基团的电子云密度变化，产生电子张力，降低了底物的活化能 ①、酶从低活性形式转变为高活性形式，利于催化。 ②、底物形变，利于形成ES复合物。 ③、底物构象变化，过度态结构，大大降低活化能;溶菌酶;1、定义：酶分子的一些功能基团起瞬时质子供体或质子受体的作用，降低了活化能加速了反应，这种机制称为...。 ? Specific acid-base catalysis （H+ 或OH-) General acid-base catalysis （H+ 或OH-) + 供体 ; Many protein enzymes use general acid-base catalysis as a way to increase reaction rates（催化有机反应的最普遍有效的催化剂）; The active site of some enzymes contain amino acid functional group, such as those shown here, can participate in acid-base catalysis; The active site of some enzymes contain amino acid functional group, such as those shown here, can participate in acid-base catalysis;思考题; 3、影响酸碱催化反应速度的两个因素 ⑴ 酸碱强度(pK值）。组氨酸咪唑基的解离常数为6， 在pH6附近给出质子和结合质子能力相同，是最活泼 的催化基团。 ⑵ 给出质子或结合质子的速度。咪唑基最快，半寿期 小于10-10 秒;思考题;思考题; Nucleotides;H2O; (1). 共价催化：酶作为亲核基团或亲电基团，与底物形成一个反应活性很高的共价中间物，此中间物易变成过渡态，反应活化能大大降低，提高反应速度。;（2）.共价催化分类;共价催化集团;共价催化举例-胰凝乳蛋白酶;共价催化举例-胰凝乳蛋白酶;（区分）可逆的共价修饰的调控;（五）、活性中心金属离子的催化作用;; Carbonic Anhydrase: Zinc Activation of Water, The activated water (hydroxide ion) acts as a nucleophile亲和基团 , attacking the carbon dioxide, forming bicarbonate; 基元催化：由某些集团或小分子催化的反应，如 1、酸碱催化 2、共价催化； 3、活性中心金属离子; 多元催化和协同催化：多元催化常